35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3062 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3062  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
84 aa  162  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20840  aryl carrier domain protein  38.64 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  decreased coverage  0.00638863 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  41.1 
 
 
287 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  39.71 
 
 
1414 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3692  phosphopantetheine-binding protein  41.33 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  36.25 
 
 
1167 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  36.25 
 
 
1167 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  44.62 
 
 
297 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  44.62 
 
 
297 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  36.25 
 
 
1167 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  44.62 
 
 
297 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  41.27 
 
 
1152 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1868  isochorismatase  39.44 
 
 
84 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  42.86 
 
 
297 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  41.33 
 
 
295 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  41.33 
 
 
295 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  41.33 
 
 
295 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  41.33 
 
 
295 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3849  amino acid adenylation domain-containing protein  37.5 
 
 
1149 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239228  normal  0.864277 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  41.33 
 
 
295 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  41.33 
 
 
295 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  40 
 
 
291 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  42.86 
 
 
297 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  43.84 
 
 
327 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  36.51 
 
 
278 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  33.85 
 
 
293 aa  44.7  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  55.56 
 
 
285 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  37.5 
 
 
291 aa  42.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0643  AMP-dependent synthetase and ligase  39.66 
 
 
640 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.597894  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  40 
 
 
284 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3616  phosphopantetheine-binding  35.62 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0874  dihydroaeruginoic acid synthetase  44.23 
 
 
1436 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.78 
 
 
319 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09270  dihydroaeruginoic acid synthetase  39.66 
 
 
1438 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.720802  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  44.44 
 
 
1131 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>