35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4331 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4331  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 
440 aa  851    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27870  hypothetical protein  31.47 
 
 
515 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2962  hypothetical protein  32.99 
 
 
547 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.41173  hitchhiker  0.00173595 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2495  hypothetical protein  30.36 
 
 
543 aa  122  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3473  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 
580 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8187  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.14 
 
 
593 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8552  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.21 
 
 
587 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4328  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.22 
 
 
568 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238879  normal  0.546066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3158  hypothetical protein  39.75 
 
 
542 aa  91.3  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0373  hypothetical protein  29.29 
 
 
454 aa  90.1  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.417823  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0814  hypothetical protein  36 
 
 
420 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0429314  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0478  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.15 
 
 
471 aa  76.3  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.298298  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4786  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.07 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0569189  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.75 
 
 
605 aa  73.2  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0084  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0306  hypothetical protein  37.8 
 
 
401 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5941  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.05 
 
 
381 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0027  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.05 
 
 
367 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25300  membrane-fusion protein  38.37 
 
 
379 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1030  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.94 
 
 
410 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13226 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3175  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.66 
 
 
363 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0082  hypothetical protein  35.14 
 
 
391 aa  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.619134 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09470  putative peptidoglycan binding protein  27.32 
 
 
335 aa  52.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265495  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1588  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.31 
 
 
359 aa  51.2  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0248929  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2217  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.98 
 
 
356 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743158  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  43.4 
 
 
243 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.65 
 
 
270 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  42.86 
 
 
358 aa  46.6  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0582  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.77 
 
 
405 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246879  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2792  hypothetical protein  51.22 
 
 
264 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19610  negative regulator of beta-lactamase expression  45.9 
 
 
248 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611508 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21610  hypothetical protein  35 
 
 
351 aa  44.3  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13610  hypothetical protein  31.16 
 
 
431 aa  43.9  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.470397 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.89 
 
 
327 aa  43.1  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.28 
 
 
249 aa  43.1  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>