44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1913 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4029  ATPase-like protein  64.83 
 
 
580 aa  687    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1913  ATPase-like protein  100 
 
 
578 aa  1154    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2386  ATPase-like protein  66.61 
 
 
589 aa  733    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000327253  hitchhiker  0.000621551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1498  hypothetical protein  64.68 
 
 
582 aa  727    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3775  hypothetical protein  65.32 
 
 
613 aa  701    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464348  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1553  hypothetical protein  63.93 
 
 
582 aa  725    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1724  ATPase  48.78 
 
 
585 aa  477  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1662  hypothetical protein  47.8 
 
 
577 aa  470  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1417  hypothetical protein  47.67 
 
 
606 aa  465  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0731587  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0907  hypothetical protein  39.39 
 
 
571 aa  384  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6133  ATPase-like protein  40.91 
 
 
630 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.869987  normal  0.698643 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1563  ATPase-like protein  34 
 
 
611 aa  276  5e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1514  ATPase-like protein  34 
 
 
611 aa  276  5e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0452  hypothetical protein  27.43 
 
 
682 aa  133  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  25 
 
 
1071 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  28.3 
 
 
557 aa  53.9  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  30.91 
 
 
679 aa  53.5  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  24.77 
 
 
579 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  28.95 
 
 
531 aa  52.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  23.85 
 
 
526 aa  52  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25.83 
 
 
496 aa  51.2  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  29.52 
 
 
570 aa  50.4  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  29.66 
 
 
579 aa  48.5  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  24.11 
 
 
595 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  22.56 
 
 
1106 aa  48.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  25.69 
 
 
560 aa  48.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2180  AAA ATPase  29.17 
 
 
777 aa  48.1  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.520189  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  29.41 
 
 
580 aa  47.8  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  27.19 
 
 
709 aa  47.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  31.73 
 
 
559 aa  47.4  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  24.14 
 
 
544 aa  47.4  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0115  hypothetical protein  27.83 
 
 
310 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142598 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0087  hypothetical protein  27.83 
 
 
310 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  23.98 
 
 
607 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  29.51 
 
 
577 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0051  hypothetical protein  25.93 
 
 
310 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0086  membrane protein  27.83 
 
 
310 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3642  ATPase-like  26.5 
 
 
558 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.361749  normal  0.410506 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2606  hypothetical protein  29.06 
 
 
1050 aa  44.3  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320925  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  25.15 
 
 
550 aa  44.3  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  26.81 
 
 
611 aa  43.9  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  25.23 
 
 
599 aa  43.9  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  28.49 
 
 
674 aa  43.9  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  27.73 
 
 
587 aa  43.5  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>