More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3258 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  100 
 
 
452 aa  922    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  46.94 
 
 
461 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3807  cytochrome P450  43.15 
 
 
460 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1286  cytochrome P450  43.74 
 
 
448 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316909  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  36.01 
 
 
459 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  29.86 
 
 
447 aa  219  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  35.1 
 
 
455 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  34.13 
 
 
1365 aa  216  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  31.12 
 
 
460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  31.88 
 
 
459 aa  214  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  33.97 
 
 
482 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  32.89 
 
 
452 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  29.41 
 
 
457 aa  202  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  29.23 
 
 
454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  32.29 
 
 
1373 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  32.29 
 
 
1380 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  32.05 
 
 
1373 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  32.05 
 
 
1373 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  32.05 
 
 
1373 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  32.05 
 
 
1373 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  32.21 
 
 
454 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  32.05 
 
 
1373 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  32.05 
 
 
1373 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  28.38 
 
 
444 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  30.05 
 
 
451 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  31.01 
 
 
452 aa  190  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  32.85 
 
 
447 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  28.77 
 
 
466 aa  183  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  27.79 
 
 
445 aa  180  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  28.64 
 
 
448 aa  179  8e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  28.44 
 
 
441 aa  176  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  25.85 
 
 
446 aa  176  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  32.9 
 
 
452 aa  176  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  29.45 
 
 
469 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  30.24 
 
 
462 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  31.11 
 
 
461 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  28.51 
 
 
468 aa  169  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  31.12 
 
 
479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  28.41 
 
 
439 aa  166  9e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  31.21 
 
 
489 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  29.48 
 
 
445 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  30.58 
 
 
437 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  31.75 
 
 
453 aa  163  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  29.68 
 
 
484 aa  163  6e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  29.31 
 
 
462 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  30.08 
 
 
462 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  30.45 
 
 
462 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  30 
 
 
471 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  29.76 
 
 
471 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  28.11 
 
 
459 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  31.49 
 
 
445 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  27.58 
 
 
452 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  30.22 
 
 
470 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  25.81 
 
 
432 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  31.65 
 
 
453 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  31.39 
 
 
474 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  31.39 
 
 
474 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  31.6 
 
 
429 aa  151  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  28.15 
 
 
460 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11423  cytochrome P450 132 cyp132  27.81 
 
 
461 aa  149  9e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000352831  normal  0.140869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  28.08 
 
 
463 aa  148  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  27.97 
 
 
462 aa  146  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  27.56 
 
 
467 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  28.26 
 
 
470 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  29.03 
 
 
464 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  31.91 
 
 
452 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  29.79 
 
 
467 aa  144  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0814  cytochrome P450  28.54 
 
 
444 aa  143  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  27.6 
 
 
453 aa  143  7e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  30.36 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  27.6 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  27.34 
 
 
453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  27.49 
 
 
479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  29.04 
 
 
457 aa  141  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  28.7 
 
 
466 aa  141  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  29.27 
 
 
478 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  29.02 
 
 
466 aa  140  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  25.42 
 
 
458 aa  139  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  26.89 
 
 
464 aa  139  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  27.11 
 
 
470 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  30.65 
 
 
459 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  30.65 
 
 
459 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  26.79 
 
 
473 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  26.79 
 
 
473 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0245  cytochrome P450  30.95 
 
 
465 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.252682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  28.5 
 
 
473 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  27.63 
 
 
462 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  26.43 
 
 
473 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  28.46 
 
 
466 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  27.93 
 
 
433 aa  137  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  29.61 
 
 
463 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  27.34 
 
 
452 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  27.74 
 
 
465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  30 
 
 
453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  31.3 
 
 
452 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  29 
 
 
474 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  27.79 
 
 
480 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  25.92 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  27.03 
 
 
463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1697  cytochrome P450  25.45 
 
 
447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>