More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1459 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1459  FeS assembly protein SufD  100 
 
 		 368 aa  740    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1413  FeS assembly protein SufD  98.1 
 
 		 368 aa  729    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0049  SufBD protein  40.61 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0654  SufBD protein  33.83 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0267  SufBD protein  32.27 
 
 		 375 aa  106  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0668  FeS assembly protein SufD  27.67 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0219  hypothetical protein  27.73 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1973  hypothetical protein  27.78 
 
 		 418 aa  96.3  8e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  23.31 
 
 		 396 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  25.77 
 
 		 435 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  25.77 
 
 		 435 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  26.92 
 
 		 435 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0142  hypothetical protein  26.95 
 
 		 420 aa  92.8  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2037  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  28.51 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1140  SufBD protein  36.3 
 
 		 373 aa  92  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  29.02 
 
 		 430 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  29.02 
 
 		 430 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  29.02 
 
 		 430 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  29.15 
 
 		 430 aa  90.1  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  29.02 
 
 		 430 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  29.02 
 
 		 430 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  29.02 
 
 		 430 aa  89.7  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  29.02 
 
 		 430 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  28.4 
 
 		 404 aa  89.4  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  29.02 
 
 		 430 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  29.02 
 
 		 430 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  29.02 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1113  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  32.62 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  32.68 
 
 		 437 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2330  SufBD protein  28.5 
 
 		 349 aa  85.9  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  27.59 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  26.53 
 
 		 472 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  28.1 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  28.24 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3073  FeS assembly protein SufD  27.35 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  28.84 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  35.16 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  31.16 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  35.16 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0892  FeS assembly protein SufD  32.74 
 
 		 429 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  27.78 
 
 		 479 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  26.72 
 
 		 470 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  26.44 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0174  SufBD protein  27.12 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21950  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.31 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  24.57 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  25.86 
 
 		 476 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0489  SufBD protein  32.5 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31169 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  26.29 
 
 		 470 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1502  SufBD protein  31.33 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.56 
 
 		 483 aa  80.5  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0378  SufBD protein  32.28 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0643358  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03041  ABC transporter, membrane component  28.19 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  25.86 
 
 		 470 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  25.43 
 
 		 470 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.91 
 
 		 470 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  25 
 
 		 470 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  26.39 
 
 		 485 aa  79.7  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  25.43 
 
 		 476 aa  79.3  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2920  SufBD protein  30.71 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.689124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  26.51 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  26.51 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.7 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  24.14 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0406  ABC transporter, membrane component  36.61 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.449797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  25 
 
 		 470 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  26.29 
 
 		 470 aa  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  28.69 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2442  FeS assembly protein SufB  26.18 
 
 		 477 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0668958  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  33.96 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  24.14 
 
 		 472 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11489  hypothetical protein  26.09 
 
 		 846 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000249036  normal  0.700584 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2430  SufBD protein  30.15 
 
 		 408 aa  76.3  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2508  FeS assembly protein SufD  25.26 
 
 		 392 aa  75.9  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.62478  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1434  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly permease component  31.36 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.56656  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01351  ABC transporter, membrane component  31.36 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.228758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0400  SufBD protein  24.39 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.524622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  25.23 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  25.23 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  26.39 
 
 		 552 aa  74.7  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  26.82 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  29 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  25 
 
 		 481 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  23.55 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  26.51 
 
 		 479 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  24.29 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  25.66 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  24.29 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  24.8 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  23.55 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  26.51 
 
 		 485 aa  74.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  30.83 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  23.28 
 
 		 485 aa  73.9  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  25 
 
 		 481 aa  73.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.09 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  24.36 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  26.09 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  26.09 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  26.09 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  25.93 
 
 		 478 aa  72.8  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>