37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3513 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3513  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 279 aa  570  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0824  glycosyl transferase family protein  37.64 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1547  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1605  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1207  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.539857  hitchhiker  0.00960164 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2114  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.953679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1934  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.0365788 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0986  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0116  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4381  glycosyl transferase family 25  24.38 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0643142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04234  glycosyltransferase  28.31 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0728  LPS biosynthesis glycosyltransferase  33.33 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0207  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.757626  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0457  ExsB  38.46 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.15278  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0075  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.3559 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  31.84 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2231  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 		 251 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1375  glycosyl transferase family protein  29.94 
 
 		 241 aa  52.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2116  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87908  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3775  glycosyl transferase family 25  26.11 
 
 		 265 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3927  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 250 aa  50.8  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512494  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0987  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.272877  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 		 262 aa  49.7  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1218  putative glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis  32.97 
 
 		 260 aa  49.3  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3344  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 		 250 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.297901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0337  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.435264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0321  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0415  glycosyl transferase family protein  24.16 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0702  glycosyl transferase family 25  26.51 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161368  normal  0.881602 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0614  hypothetical protein  33.64 
 
 		 759 aa  47  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.865604  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0608  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 		 255 aa  45.8  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0615  hypothetical protein  32.71 
 
 		 703 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.370403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0378  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166362  normal  0.0272961 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0765  glycosyl transferase family 25  28.99 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.310096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3129  glycosyl transferase  33.33 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>