More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3440 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0443  glycerol kinase  62.53 
 
 		 498 aa  636    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.59607  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0281  glycerol kinase  63.36 
 
 		 519 aa  671    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5976  glycerol kinase  64.15 
 
 		 500 aa  651    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2662  glycerol kinase  66.8 
 
 		 493 aa  679    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3131  glycerol kinase  66.6 
 
 		 497 aa  677    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0386  glycerol kinase  62.93 
 
 		 498 aa  639    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.791585  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1763  glycerol kinase  64.98 
 
 		 501 aa  655    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197449  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1200  glycerol kinase  67.81 
 
 		 493 aa  693    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.279675  normal  0.769167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3683  glycerol kinase  69.88 
 
 		 489 aa  696    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.625574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2231  glycerol kinase  64.78 
 
 		 529 aa  673    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.633532  normal  0.0750986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3544  glycerol kinase  65.18 
 
 		 500 aa  683    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0360  glycerol kinase  65.79 
 
 		 503 aa  691    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4501  glycerol kinase  65.17 
 
 		 497 aa  679    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.212836 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3440  glycerol kinase  100 
 
 		 494 aa  1009    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1598  glycerol kinase  63.66 
 
 		 500 aa  652    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1239  glycerol kinase  64.84 
 
 		 502 aa  672    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2618  glycerol kinase  66.19 
 
 		 495 aa  683    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4386  glycerol kinase  66.19 
 
 		 496 aa  684    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7067  glycerol kinase  65.79 
 
 		 500 aa  689    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.417411 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3420  glycerol kinase  70.67 
 
 		 519 aa  738    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  67.95 
 
 		 507 aa  691    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4226  glycerol kinase  65.18 
 
 		 500 aa  657    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0545781  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2859  glycerol kinase  65.78 
 
 		 497 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6463  glycerol kinase  64.15 
 
 		 500 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.977008  normal  0.690577 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1320  glycerol kinase  66.8 
 
 		 493 aa  679    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3316  glycerol kinase  63.34 
 
 		 497 aa  625  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307354  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2809  glycerol kinase  62.2 
 
 		 497 aa  617  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.507542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  59.51 
 
 		 494 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  59.71 
 
 		 494 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00242  probable carbohydrate kinase  58.57 
 
 		 494 aa  598  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  57.35 
 
 		 501 aa  595  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  57.67 
 
 		 495 aa  595  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3533  glycerol kinase  58.16 
 
 		 497 aa  588  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2319  glycerol kinase  57.26 
 
 		 493 aa  586  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160007  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2704  glycerol kinase  56.68 
 
 		 497 aa  571  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3953  glycerol kinase  55.83 
 
 		 494 aa  568  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  56.06 
 
 		 498 aa  569  1e-161  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  55.21 
 
 		 496 aa  569  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  55.21 
 
 		 496 aa  567  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  55.21 
 
 		 496 aa  566  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  54.81 
 
 		 496 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  55.01 
 
 		 496 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  55.01 
 
 		 496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  54.81 
 
 		 496 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  55.01 
 
 		 496 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  54.69 
 
 		 496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  55.01 
 
 		 496 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  53.58 
 
 		 499 aa  558  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  55.6 
 
 		 496 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  53.55 
 
 		 496 aa  559  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  53.55 
 
 		 496 aa  556  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  54.4 
 
 		 498 aa  554  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2621  glycerol kinase  59.02 
 
 		 504 aa  553  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  54.4 
 
 		 498 aa  554  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  54 
 
 		 507 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  55.03 
 
 		 497 aa  549  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  54 
 
 		 507 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  54 
 
 		 507 aa  549  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  56.01 
 
 		 499 aa  548  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  55.92 
 
 		 501 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  54.88 
 
 		 499 aa  545  1e-154  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1141  glycerol kinase  52.85 
 
 		 514 aa  548  1e-154  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.125497  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  55.1 
 
 		 520 aa  545  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1011  glycerol kinase  52.64 
 
 		 501 aa  545  1e-154  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00463589  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  54.41 
 
 		 503 aa  543  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  55.38 
 
 		 501 aa  544  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  56.78 
 
 		 505 aa  544  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  53.91 
 
 		 494 aa  544  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  53.91 
 
 		 494 aa  544  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  55.19 
 
 		 496 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  53.91 
 
 		 494 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1461  glycerol kinase  54.67 
 
 		 499 aa  542  1e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  54.51 
 
 		 499 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  52.98 
 
 		 516 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  53.8 
 
 		 503 aa  538  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  52.86 
 
 		 495 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  53.35 
 
 		 498 aa  541  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  53.59 
 
 		 502 aa  538  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  53.8 
 
 		 503 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  53.48 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  53.48 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  53.48 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  54.1 
 
 		 505 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  53.48 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  52.98 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  53.48 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  53.8 
 
 		 500 aa  537  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  53.48 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  54.1 
 
 		 499 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  53.48 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  53.48 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  53.48 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  53.86 
 
 		 505 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  53.28 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  53.8 
 
 		 495 aa  536  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  54.21 
 
 		 499 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  53.48 
 
 		 501 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  53.36 
 
 		 494 aa  533  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  52.88 
 
 		 510 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  52.76 
 
 		 513 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>