267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2604 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_2604  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
176 aa  362  1e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.57312  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3667  GCN5-related N-acetyltransferase  46.71 
 
 
167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1058  hypothetical protein  45.12 
 
 
166 aa  136  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2104  GCN5-related N-acetyltransferase  44.79 
 
 
169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0346868 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0177  acetyltransferase  38.95 
 
 
178 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2713  putative acetyltransferase  38.37 
 
 
178 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.699108  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1052  acetyltransferase  38.37 
 
 
178 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2605  hypothetical protein  40.12 
 
 
201 aa  107  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.463816  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0752  GCN5-related N-acetyltransferase  42.5 
 
 
170 aa  107  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0351  GCN5-related N-acetyltransferase  40.37 
 
 
171 aa  105  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.988966  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0753  acetyltransferase  41.1 
 
 
172 aa  105  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0317  GCN5-related N-acetyltransferase  37.87 
 
 
184 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0754  GCN5-related N-acetyltransferase  36.26 
 
 
179 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0350  hypothetical protein  38.12 
 
 
201 aa  98.2  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0751  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 
164 aa  94.7  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0202  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
181 aa  88.2  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3879  GCN5-related N-acetyltransferase  38.32 
 
 
176 aa  87.4  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332564  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1051  hypothetical protein  39.43 
 
 
176 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2712  GCN5-related N-acetyltransferase  39.43 
 
 
176 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.757846  normal  0.0335255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0178  GCN5-related N-acetyltransferase  40.11 
 
 
176 aa  85.5  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0352  acetyltransferase  35.98 
 
 
177 aa  85.1  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
207 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0755  acetyltransferase  35.17 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1187  GCN5-related N-acetyltransferase  33.97 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1431  acetyltransferase  36.36 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2642  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958257  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0820  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350892  normal  0.227447 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
189 aa  72  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  32.1 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.249566 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4082  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4585  GCN5-related N-acetyltransferase  33.97 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 
181 aa  67.4  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4735  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43909  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2827  hypothetical protein  28.92 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3234  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.812854  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1050  acetyltransferase  37.74 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0179  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 
186 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 
177 aa  62  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3043  GCN5-related N-acetyltransferase  32.19 
 
 
196 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
185 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1793  hypothetical protein  28.21 
 
 
190 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.53536  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4301  GCN5-related N-acetyltransferase  38.3 
 
 
185 aa  59.7  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0629875  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2711  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
186 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.764957  normal  0.0336934 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  32.41 
 
 
188 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0244  GNAT family acetyltransferase  28 
 
 
178 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  32.21 
 
 
191 aa  58.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  26.99 
 
 
177 aa  58.2  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  29.22 
 
 
396 aa  57  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1787  acetyltransferase  29.94 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.600218  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1272  acetyltransferase  29.94 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.149301  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2810  acetyltransferase  30.26 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1960  acetyltransferase  29.94 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00531041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4417  GCN5-related N-acetyltransferase  26.39 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1031  acetyltransferase  29.94 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.462594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1808  acetyltransferase  29.94 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0135  acetyltransferase  29.94 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2876  acetyltransferase  23.73 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0284819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2895  acetyltransferase, GNAT family  23.86 
 
 
175 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  31.17 
 
 
189 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2526  acetyltransferase  29.3 
 
 
184 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0308395  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3625  hypothetical protein  28.09 
 
 
176 aa  55.1  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1799  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
180 aa  55.1  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873106  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2577  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 
169 aa  55.1  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.230542  normal  0.273623 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4445  acetyltransferase, GNAT family  30.34 
 
 
168 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4593  acetyltransferase  30.34 
 
 
168 aa  54.7  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  33.61 
 
 
195 aa  54.7  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  37.08 
 
 
182 aa  54.3  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  30 
 
 
188 aa  54.3  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1760  acetyltransferase  29.22 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.319622  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1059  GCN5-related N-acetyltransferase  31.72 
 
 
185 aa  53.9  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184612 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4484  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.28 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  37.08 
 
 
182 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6386  GCN5-related N-acetyltransferase  32.11 
 
 
196 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725822 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0318  GCN5-related N-acetyltransferase  32.48 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2268  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0903  putative acetyltransferase  28.66 
 
 
177 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1341  acetyltransferase  34.27 
 
 
186 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4446  acetyltransferase  29.66 
 
 
168 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.949941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2656  acetyltransferase  24.42 
 
 
175 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00207068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4098  acetyltransferase  29.66 
 
 
168 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  31.25 
 
 
359 aa  52.4  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4109  acetyltransferase  29.66 
 
 
168 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2847  acetyltransferase  24.42 
 
 
175 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.657353  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 
192 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4498  acetyltransferase, GNAT family  29.66 
 
 
168 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3081  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 
168 aa  52.4  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4991  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 
192 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0659078  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 
189 aa  51.6  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1936  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
194 aa  51.2  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  25.95 
 
 
175 aa  51.2  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0752  acetyltransferase, GNAT family  29.66 
 
 
168 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2607  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.7 
 
 
175 aa  51.2  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146857  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  30.52 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12850  acetyltransferase  35.53 
 
 
192 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.82898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>