More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1479 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 442 aa  891    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  52.74 
 
 		 439 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.97 
 
 		 439 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.51 
 
 		 439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1921  histidine kinase  48.62 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000693193  hitchhiker  0.00000000000506219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.36 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1771  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 		 445 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 468 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_004310  BR1522  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  38.8 
 
 		 432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 462 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1643  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 447 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291283  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 462 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 462 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 453 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 464 aa  262  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.551338  normal  0.47179 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.28 
 
 		 462 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 477 aa  259  9e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 462 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1473  putative osmolarity sensor protein EnvZ  38.85 
 
 		 416 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0547648  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2807  histidine kinase  38.25 
 
 		 468 aa  253  7e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.85206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7273  histidine kinase  37.82 
 
 		 472 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567939  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2584  ATPase domain-containing protein  38.25 
 
 		 468 aa  252  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0990  sensor histidine kinase  35.7 
 
 		 446 aa  250  4e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0170043  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6014  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 474 aa  249  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 460 aa  249  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 		 456 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.486419  normal  0.695508 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2747  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.618913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2145  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 469 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3010  histidine kinase  37.27 
 
 		 458 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2246  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3166  two component sensor kinase  37.9 
 
 		 440 aa  236  9e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 468 aa  229  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 450 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 441 aa  209  8e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 467 aa  190  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.913369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 		 717 aa  175  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 493 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 485 aa  163  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 469 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 442 aa  162  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  40.54 
 
 		 435 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  38.95 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 453 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  36.36 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  36.36 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  39.64 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  36.36 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  36.36 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  36.36 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  32.02 
 
 		 444 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  36.36 
 
 		 450 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4710  osmolarity sensor protein  36.36 
 
 		 450 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.570266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 488 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  39.11 
 
 		 452 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 488 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  36.36 
 
 		 450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  36.36 
 
 		 450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  36.36 
 
 		 450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  36.36 
 
 		 450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  36.36 
 
 		 450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  37.1 
 
 		 442 aa  154  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  34.29 
 
 		 430 aa  154  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  36.27 
 
 		 450 aa  153  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  36.27 
 
 		 450 aa  153  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3783  osmolarity sensor protein  36 
 
 		 450 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  35.92 
 
 		 450 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  35.88 
 
 		 425 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  41.31 
 
 		 471 aa  152  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  33.33 
 
 		 425 aa  152  8.999999999999999e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 425 aa  152  8.999999999999999e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  36.73 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 349 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2318  sensor histidine kinase  34.81 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  40.23 
 
 		 276 aa  152  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 431 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  29.39 
 
 		 446 aa  151  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  36.01 
 
 		 435 aa  150  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  37.27 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  38.6 
 
 		 454 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  27.82 
 
 		 438 aa  150  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  36.3 
 
 		 467 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  32.77 
 
 		 469 aa  149  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  35.42 
 
 		 438 aa  149  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 330 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  37.78 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  34.29 
 
 		 430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  38.01 
 
 		 453 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 464 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  37.64 
 
 		 482 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  39.07 
 
 		 439 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>