148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_R0014 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.654182  normal  0.6782 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0010  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 85 bp  127  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0025  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 86 bp  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 85 bp  103  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt22  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt22  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0015  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 90 bp  95.6  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0052  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129877  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0750  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 85 bp  79.8  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0310097  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1215  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0039  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00489607  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0010  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0034  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.566958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0092  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.32054  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0053  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0708883  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0042  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.59111  normal  0.0140325 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0048  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08460  tRNA-Leu  95 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0705236  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA41  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0905521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0038  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0049  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.623993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0061  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730488  normal  0.489102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0081  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0051  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.751283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0053  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0012  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6043  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.843688 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1859  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0024  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0027  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.985368  normal  0.200865 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0031  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0308753  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0007  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0034  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309184  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309276  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.319265  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0057  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279564 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2213  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.34257  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4338  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0042  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0052  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0008  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.429157  normal  0.0709893 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0050  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00562021  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0013  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0009  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.553252  normal  0.0230597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0111  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0037  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.477957  normal  0.0356548 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309360  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07707  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.650845  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3563  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3566  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0055  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.796576  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0032  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148891  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0019  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0001  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0047  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0003    90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0028  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0012  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.145187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0007  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0003  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0003  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.426461  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00820  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503548  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0015  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA2  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.839683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0041  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0554879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0003  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0006  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0027  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000026445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0033  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0086  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000003449  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0020    100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00753616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0008  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.364833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0068  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000622539  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0005  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000679583  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0023  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0005  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.570293  normal  0.011385 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0009  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0006  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.26401 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0071  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193194  normal  0.106914 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>