271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2422 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2422  Queuosine synthesis-like protein  100 
 
 		 217 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2927  ExsB family protein  51.5 
 
 		 213 aa  188  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  38.81 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  35.16 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  38.57 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1885  exsB protein  32.55 
 
 		 223 aa  108  9.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  35.43 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0998  exsB protein  36.82 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.519707  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  36.82 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000696721  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  33.04 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1310  exsB protein  33.33 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  33.64 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  34.86 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  35.68 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  37.39 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  33.49 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0106  exsB protein  30.7 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  35.78 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  33.64 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  33.19 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  35.78 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  33.64 
 
 		 228 aa  101  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  32.73 
 
 		 224 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  36.2 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  31.02 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  35.71 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  34.7 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  35.71 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  35.59 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753404  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  30.77 
 
 		 251 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  33.63 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  33.03 
 
 		 224 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2202  ExsB ATPase  36.28 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000761719 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  36.07 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  28.7 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  34.96 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  35.02 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  35.91 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2420  exsB protein  32.74 
 
 		 243 aa  99  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.107202 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01572  ExsB protein  35.65 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.779183  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0438  exsB protein  28.77 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000182175  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  34.22 
 
 		 228 aa  99  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  35.02 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  34.4 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0272  exsB protein  31.58 
 
 		 246 aa  99  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1568  ExsB family protein  29.8 
 
 		 199 aa  99  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.759596  normal  0.035256 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  34.68 
 
 		 225 aa  98.6  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  35 
 
 		 237 aa  98.6  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  31.67 
 
 		 227 aa  98.2  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  29.6 
 
 		 258 aa  97.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  32.11 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  34.68 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  35.22 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  28.57 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  35.22 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  35.62 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  36.7 
 
 		 229 aa  96.3  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  31.51 
 
 		 244 aa  96.3  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1355  ExsB  37.27 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  27.31 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4185  exsB protein  31.36 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303394  normal  0.206688 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  31.96 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  35.87 
 
 		 234 aa  95.9  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2038  ExsB  30.8 
 
 		 251 aa  95.5  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  30.34 
 
 		 243 aa  95.5  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  34.55 
 
 		 224 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  31.36 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  33.33 
 
 		 225 aa  95.1  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  27.44 
 
 		 218 aa  94.7  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3719  succinoglycan biosynthesis regulator  32.42 
 
 		 235 aa  94.7  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.351493  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  31.22 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  33.93 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  35.62 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000226628  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  34.09 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  33.79 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  34.09 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  34.63 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  29.33 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  33.18 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  34.09 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  34.4 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1097  exsB protein  30.23 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0772  exsB protein  25.33 
 
 		 234 aa  93.2  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  31.53 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2047  ExsB  29.36 
 
 		 233 aa  92.8  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3788  exsB protein  31.65 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  34.35 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  32.09 
 
 		 233 aa  92  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0861  exsB protein  33.86 
 
 		 220 aa  91.3  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36600  ExsB protein  34.55 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1010  exsB protein  33.03 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  32.03 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3493  exsB protein  31.19 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  30.22 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  27.78 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 285 aa  89  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1897  exsB protein  30.73 
 
 		 232 aa  88.6  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3919  exsB protein  38.12 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  32.59 
 
 		 257 aa  88.6  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02725  putative regulator protein  25.58 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>