More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1400 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  100 
 
 
375 aa  728    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  47.33 
 
 
405 aa  306  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  45.05 
 
 
392 aa  287  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  43.81 
 
 
395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  43.99 
 
 
437 aa  281  9e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  44.25 
 
 
404 aa  270  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  44.7 
 
 
388 aa  270  4e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  43.7 
 
 
404 aa  265  8e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  42.89 
 
 
387 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  43.86 
 
 
379 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  40.67 
 
 
384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  40.51 
 
 
384 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2873  flagellin  41.67 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0090  flagellin  41.67 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3870  flagellin  41.67 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3102  flagellin  41.67 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586879  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3448  flagellin  41.67 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0953619  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3952  flagellin  41.67 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1671  flagellin  41.67 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  40.25 
 
 
384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  40.25 
 
 
384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  41.1 
 
 
379 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5252  flagellin  41.26 
 
 
398 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  40.68 
 
 
377 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  40.05 
 
 
379 aa  237  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0223  flagellin  39.31 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778808  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  40.21 
 
 
377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  39 
 
 
393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  38.1 
 
 
376 aa  233  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  38.26 
 
 
376 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  39.95 
 
 
378 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0103  flagellin  41.31 
 
 
381 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  37.99 
 
 
378 aa  230  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  42.7 
 
 
319 aa  229  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  38.58 
 
 
377 aa  229  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  38.58 
 
 
377 aa  229  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  40 
 
 
394 aa  229  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  38.56 
 
 
377 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  42.32 
 
 
319 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  37.73 
 
 
402 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  40.74 
 
 
377 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  38.56 
 
 
377 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3832  flagellin  40.55 
 
 
381 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  40.74 
 
 
376 aa  226  6e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  37.37 
 
 
375 aa  223  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  42.26 
 
 
380 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  42.67 
 
 
356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  38.44 
 
 
377 aa  219  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  37.13 
 
 
383 aa  219  6e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  39.18 
 
 
412 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  37.44 
 
 
377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  39.55 
 
 
404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  37.17 
 
 
385 aa  210  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1781  flagellin domain-containing protein  37.44 
 
 
420 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.964824  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  59.47 
 
 
462 aa  206  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  36.38 
 
 
420 aa  206  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  60.43 
 
 
609 aa  204  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1476  flagellin domain-containing protein  36.78 
 
 
391 aa  201  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  64.46 
 
 
492 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  59.67 
 
 
431 aa  196  7e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  63.1 
 
 
490 aa  194  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  66.23 
 
 
493 aa  192  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  35.9 
 
 
327 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  49.34 
 
 
494 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  64.78 
 
 
501 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  63.12 
 
 
492 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  55.26 
 
 
475 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01302  flagellin  35.46 
 
 
374 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  54.74 
 
 
475 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004160  flagellin protein flaE  36.1 
 
 
374 aa  186  7e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000739786  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2385  flagellin domain protein  37.37 
 
 
315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  48.97 
 
 
497 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  35.95 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  61.73 
 
 
488 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  63.19 
 
 
486 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  63.64 
 
 
506 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  53.37 
 
 
472 aa  182  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3196  flagellin  56.47 
 
 
383 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  51.92 
 
 
471 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2361  flagellin-like  36.46 
 
 
327 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0506  flagellin domain-containing protein  60.38 
 
 
492 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  51.91 
 
 
580 aa  179  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  55.49 
 
 
276 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  60.38 
 
 
469 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1478  flagellin domain-containing protein  37.11 
 
 
372 aa  177  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  59.6 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  54.12 
 
 
492 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  59.6 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  53.29 
 
 
467 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0172  flagellin-like  32.99 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  58.49 
 
 
272 aa  172  6.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2430  flagellin domain protein  33.69 
 
 
308 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  58.49 
 
 
272 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0834  flagellin domain-containing protein  35.14 
 
 
399 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.9933 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  57.23 
 
 
272 aa  170  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2200  flagellin FliC  55.62 
 
 
587 aa  170  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  55.09 
 
 
492 aa  170  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  55.7 
 
 
279 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  55.7 
 
 
279 aa  169  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  57.14 
 
 
294 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>