More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0424 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0424  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
428 aa  857    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0842  protein of unknown function DUF21  65.22 
 
 
430 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2263  hypothetical protein  54.55 
 
 
440 aa  461  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.830702  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0469  hypothetical protein  53.79 
 
 
426 aa  456  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272499  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1166  hypothetical protein  56.28 
 
 
427 aa  458  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0092  hypothetical protein  52.16 
 
 
426 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0306325  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002533  putative hemolysin  51.68 
 
 
422 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0886  hypothetical protein  53.92 
 
 
429 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2313  hypothetical protein  51.71 
 
 
426 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1046  hypothetical protein  52.16 
 
 
427 aa  435  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0461701  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1156  hypothetical protein  51.83 
 
 
431 aa  433  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0523696  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  52.33 
 
 
424 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3370  hemolysin  50.96 
 
 
423 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1060  hypothetical protein  53.4 
 
 
427 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00777196  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2757  hypothetical protein  52.44 
 
 
428 aa  430  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000928443  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2923  hypothetical protein  53.19 
 
 
426 aa  430  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1165  hypothetical protein  52.64 
 
 
423 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.132593  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1354  hemolysin protein, putative  52.35 
 
 
423 aa  425  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  49.88 
 
 
424 aa  425  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2841  hypothetical protein  52.71 
 
 
423 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.063755  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2923  hypothetical protein  53.02 
 
 
423 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.801289  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3020  hypothetical protein  52.71 
 
 
423 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000521324  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0646  putative transport protein  49.18 
 
 
423 aa  423  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  47.55 
 
 
429 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1207  hypothetical protein  53.5 
 
 
424 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000421474  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1251  hypothetical protein  53.75 
 
 
424 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000842338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3106  protein of unknown function DUF21  53.5 
 
 
424 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000105483  normal  0.0439763 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1284  hypothetical protein  53.5 
 
 
424 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121999  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  50.37 
 
 
421 aa  418  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3773  hypothetical protein  48.79 
 
 
418 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39600  Mg/Co transporter-like protein  48.83 
 
 
426 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  50.82 
 
 
428 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3019  hypothetical protein  51.26 
 
 
427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00496912  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03483  hypothetical protein  50.38 
 
 
395 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2811  hypothetical protein  46.9 
 
 
421 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2680  hypothetical protein  46.9 
 
 
421 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3232  hypothetical protein  47.1 
 
 
418 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000119021  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3367  hypothetical protein  47.1 
 
 
427 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00577149  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0849  hypothetical protein  47.86 
 
 
429 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000648521  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3093  hypothetical protein  47.07 
 
 
413 aa  391  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000167222  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1622  magnesium and cobalt efflux protein  47.51 
 
 
417 aa  385  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0117884  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0561  HlyC/CorC (HCC) family protein  47.51 
 
 
417 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000191293  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1062  protein of unknown function DUF21  45.12 
 
 
413 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000790091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3001  hypothetical protein  45.57 
 
 
420 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119732  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2895  hypothetical protein  45.61 
 
 
413 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132173  normal  0.997899 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2764  hypothetical protein  45.57 
 
 
420 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000294524  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2896  hypothetical protein  45.57 
 
 
420 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147354  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2825  hypothetical protein  45.61 
 
 
413 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00280306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1071  hypothetical protein  45.12 
 
 
413 aa  381  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0188831  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2771  hypothetical protein  45.57 
 
 
420 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000124547  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2893  hypothetical protein  45.61 
 
 
413 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1429  transporter  46.04 
 
 
419 aa  380  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.836538  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3007  hypothetical protein  45.37 
 
 
413 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2875  hypothetical protein  45.37 
 
 
413 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.156935  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2371  transmembrane protein  45.96 
 
 
432 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.242025 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0996  hypothetical protein  46.65 
 
 
428 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0640  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  43.74 
 
 
423 aa  368  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1176  protein of unknown function DUF21  45.82 
 
 
426 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50437  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2704  protein of unknown function DUF21  45.02 
 
 
424 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3069  protein of unknown function DUF21  45.02 
 
 
424 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319515  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1200  metal dependent phosphohydrolase  47.62 
 
 
426 aa  362  6e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3664  hypothetical protein  43.2 
 
 
430 aa  362  9e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000481216  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02501  predicted inner membrane protein  44.81 
 
 
398 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02465  hypothetical protein  44.81 
 
 
398 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000805698  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2824  hypothetical protein  43.44 
 
 
425 aa  360  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000593821  normal  0.0984639 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0097  hypothetical protein  43.65 
 
 
457 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000140223  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0579  hypothetical protein  43.65 
 
 
457 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000460959  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2817  hypothetical protein  43.44 
 
 
497 aa  359  5e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.292015  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2132  hypothetical protein  45.54 
 
 
432 aa  359  7e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0846344  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0482  hypothetical protein  42.96 
 
 
429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000251302  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02692  hypothetical protein  48.14 
 
 
394 aa  348  9e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000130738  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3530  putative transporter  43.5 
 
 
431 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3252  putative transporter  43.5 
 
 
431 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2530  CBS domain-containing protein  43.5 
 
 
431 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1310  CBS domain-containing protein  43.5 
 
 
431 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0452  CBS domain-containing protein  43.5 
 
 
431 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3505  putative transporter  43.5 
 
 
431 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3526  CBS domain-containing protein  43.47 
 
 
467 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1137  CBS domain-containing protein  43.03 
 
 
431 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0549  hypothetical protein  42.82 
 
 
401 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000304401  normal  0.0362947 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0507  hypothetical protein  42.31 
 
 
400 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000590838  normal  0.67931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2654  hypothetical protein  40.75 
 
 
405 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0452813  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0203  protein of unknown function DUF21  41.75 
 
 
429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.228231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3451  protein of unknown function DUF21  40.15 
 
 
403 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00533306  hitchhiker  0.000732193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0505  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  39.69 
 
 
403 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175643  normal  0.331146 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0187  hypothetical protein  41 
 
 
429 aa  317  3e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.691069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1370  hypothetical protein  44.71 
 
 
429 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0510  hypothetical protein  39.85 
 
 
420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.17258  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15930  hemolysin  43.88 
 
 
430 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467501  normal  0.32719 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  39.43 
 
 
437 aa  269  8.999999999999999e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  37.68 
 
 
442 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  35.93 
 
 
435 aa  260  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  35.01 
 
 
417 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  37.13 
 
 
442 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  37.13 
 
 
442 aa  256  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  36.13 
 
 
434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  35.75 
 
 
433 aa  253  6e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  36.63 
 
 
440 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_004310  BR2027  CBS domain-containing protein  36.15 
 
 
435 aa  246  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.765021  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1949  CBS domain-containing protein  36.15 
 
 
435 aa  246  4e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>