54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0677 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  401  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  50.98 
 
 
199 aa  195  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  41.71 
 
 
203 aa  160  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  40 
 
 
223 aa  159  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  40.98 
 
 
204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  39.79 
 
 
197 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  40.1 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  37.17 
 
 
195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  37.11 
 
 
190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  37.31 
 
 
190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  35.38 
 
 
199 aa  127  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  37.37 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  37.77 
 
 
193 aa  122  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  33.33 
 
 
203 aa  120  9e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  34.83 
 
 
204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  35.87 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  33.17 
 
 
193 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  35.14 
 
 
196 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  35.68 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  32.99 
 
 
195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  33.51 
 
 
196 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  32.49 
 
 
195 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  32.98 
 
 
197 aa  105  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  31.96 
 
 
198 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  35.23 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  41 
 
 
114 aa  95.5  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  31.13 
 
 
214 aa  94.4  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  31.94 
 
 
196 aa  94.4  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  29.61 
 
 
208 aa  91.7  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  30.39 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  29.05 
 
 
212 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  28.72 
 
 
204 aa  89  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  30.65 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  30.21 
 
 
206 aa  88.2  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  30.46 
 
 
202 aa  87.8  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  33.33 
 
 
189 aa  84  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  28 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  29.06 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  38.24 
 
 
117 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  31.73 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  37.25 
 
 
118 aa  78.6  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  36.27 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  37 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  26.88 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  25.81 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  25.81 
 
 
190 aa  72  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  26.02 
 
 
199 aa  67.8  0.00000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  35 
 
 
140 aa  63.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  40.98 
 
 
72 aa  55.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  37.31 
 
 
72 aa  44.3  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  25.37 
 
 
76 aa  43.1  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  34.85 
 
 
76 aa  41.6  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  22.39 
 
 
75 aa  41.2  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>