70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0260 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0260  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 303 aa  620  1e-177  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1740  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.14 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00299505  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2177  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.47 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2228  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.74 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.63 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.76 
 
 		 367 aa  53.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1073  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.07 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.112396  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1903  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  20.49 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.11 
 
 		 272 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0426  putative PAS/PAC sensor protein  34.48 
 
 		 556 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.79 
 
 		 275 aa  52.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.72 
 
 		 370 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1431  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.4 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.14 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.267923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1184  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.36 
 
 		 97 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.68406  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0344  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.1 
 
 		 267 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  29.09 
 
 		 485 aa  47.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  28 
 
 		 627 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1052  RNA polymerase insert  39.06 
 
 		 265 aa  47.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.127014  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  26.05 
 
 		 634 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3090  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.55 
 
 		 97 aa  46.2  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  31.34 
 
 		 159 aa  45.8  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1508  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  23.08 
 
 		 266 aa  45.8  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2803  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  21.74 
 
 		 265 aa  45.8  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.8 
 
 		 687 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1441  ferredoxin family protein  33.33 
 
 		 94 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1168  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.96 
 
 		 62 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2501  aldo/keto reductase  29.82 
 
 		 316 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00580  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  40.43 
 
 		 62 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00222598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2721  hypothetical protein  33.93 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504995  decreased coverage  0.0000694638 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1241  ferredoxin family protein  30.91 
 
 		 96 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.251684  normal  0.0451259 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24 
 
 		 699 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0324842  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1530  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 95 aa  43.9  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.753376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2145  Fe-S cluster domain-containing protein  37.25 
 
 		 435 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3775  ferredoxin I  28.3 
 
 		 62 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  32.39 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3612  formate dehydrogenase, iron-sulfur subunit  35.06 
 
 		 198 aa  44.3  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1074  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.01 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2086  ferredoxin  43.18 
 
 		 128 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2905  putative flavodoxin  26.26 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.55 
 
 		 1487 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  34.48 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  28.68 
 
 		 186 aa  43.5  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0552  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  25.66 
 
 		 786 aa  43.5  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0563725  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3762  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  21.83 
 
 		 276 aa  43.5  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4065  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.77 
 
 		 713 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.929518  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0310  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.82 
 
 		 128 aa  43.5  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4510  formate dehydrogenase, iron-sulfur subunit  35.06 
 
 		 198 aa  43.5  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3721  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.06 
 
 		 198 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0336  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.06 
 
 		 198 aa  43.5  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  25.48 
 
 		 623 aa  43.5  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3917  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.06 
 
 		 198 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.642753 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1925  ferredoxin hydrogenase  35.38 
 
 		 387 aa  43.5  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3792  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.06 
 
 		 198 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1835  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.94 
 
 		 253 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.94 
 
 		 253 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.947437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2300  putative PAS/PAC sensor protein  41.3 
 
 		 574 aa  42.7  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.252887  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0440  quinol dehydrogenase membrane component  38.71 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255918  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1588  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.74 
 
 		 579 aa  42.7  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.776403  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0310  ferredoxin hydrogenase  29.41 
 
 		 462 aa  42.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0375  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.65 
 
 		 57 aa  42.7  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0137  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.46 
 
 		 127 aa  42.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2145  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  38.1 
 
 		 262 aa  42.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000343639  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0980  glycyl-radical activating family protein  33.33 
 
 		 297 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.131362 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.19 
 
 		 83 aa  42.4  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.69 
 
 		 840 aa  42.4  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.38 
 
 		 369 aa  42.4  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.75783  normal  0.24962 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1718  quinol dehydrogenase membrane component  33.8 
 
 		 261 aa  42.4  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1215  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.73 
 
 		 368 aa  42.4  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1287  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.1 
 
 		 196 aa  42.4  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.449921  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>