46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0711 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0711  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  548  1e-155  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  32.82 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  26.72 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2099  hypothetical protein  27.69 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0571299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  27.69 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  28.08 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  30.68 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  23.94 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  25.86 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  26.37 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  26.69 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  27.65 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  25.87 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  21.29 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  24.03 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  30.18 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  24.81 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  22.83 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 		 625 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  24.6 
 
 		 626 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  24.02 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  24.8 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  29.57 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  22.44 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  24.69 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  24.6 
 
 		 281 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 		 626 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  27.62 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  23.35 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  23.53 
 
 		 280 aa  52.4  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  23.41 
 
 		 626 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  26.12 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  23.44 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  22.14 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0252  hypothetical protein  24.21 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  22.83 
 
 		 294 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  30.81 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  27.06 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  22.96 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  25 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  26.23 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  24.44 
 
 		 223 aa  46.2  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  25 
 
 		 223 aa  46.6  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  25.14 
 
 		 282 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  25.97 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  24.81 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>