More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0641 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0641  aspartate kinase  100 
 
 		 437 aa  896    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.815981  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  30.13 
 
 		 449 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  29.3 
 
 		 471 aa  170  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  29.17 
 
 		 454 aa  169  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  32.16 
 
 		 471 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  34 
 
 		 467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  28.89 
 
 		 455 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  28.38 
 
 		 455 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  29.98 
 
 		 469 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  28.82 
 
 		 458 aa  162  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  32.08 
 
 		 461 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  32.08 
 
 		 461 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  31.14 
 
 		 471 aa  161  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  31.08 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  32.08 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  30.23 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  29.4 
 
 		 458 aa  161  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  28.63 
 
 		 471 aa  160  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.35 
 
 		 817 aa  158  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  30.58 
 
 		 456 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  27.62 
 
 		 471 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4614  aspartate kinase III  29.87 
 
 		 449 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.476812 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4477  aspartate kinase III  29.87 
 
 		 449 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4411  aspartate kinase III  29.87 
 
 		 449 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135104  normal  0.165896 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4562  aspartate kinase III  29.87 
 
 		 449 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.379136 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4562  aspartate kinase III  29.87 
 
 		 449 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0535  aspartate kinase III  33.87 
 
 		 459 aa  156  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  29.75 
 
 		 452 aa  156  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0843  aspartate kinase  34.46 
 
 		 468 aa  156  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  29.27 
 
 		 456 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  27.33 
 
 		 471 aa  155  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.53 
 
 		 823 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.27 
 
 		 819 aa  154  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3079  aspartate kinase  33.43 
 
 		 467 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244781  hitchhiker  0.00296029 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  28.14 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4572  aspartate kinase III  29.07 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4263  aspartate kinase III  29.07 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4529  aspartate kinase III  29.07 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4006  aspartate kinase III  29.07 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.193511 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03896  aspartate kinase III  29.23 
 
 		 449 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3973  aspartate kinase  29.23 
 
 		 449 aa  152  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3986  aspartate kinase III  29.37 
 
 		 451 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  32.04 
 
 		 451 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5502  aspartate kinase III  29.23 
 
 		 449 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4485  aspartate kinase III  29.23 
 
 		 449 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03856  hypothetical protein  29.23 
 
 		 449 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0788  aspartate kinase III  29.6 
 
 		 451 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3717  aspartate kinase III  29.6 
 
 		 451 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345443  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0299  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.22 
 
 		 819 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3369  aspartate kinase III  29.15 
 
 		 451 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000680196  hitchhiker  0.00822859 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03418  aspartate kinase III  30.73 
 
 		 449 aa  150  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000466048  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  31.21 
 
 		 462 aa  150  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  27.85 
 
 		 478 aa  150  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0653  aspartate kinase III  29.15 
 
 		 451 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.515096  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3840  aspartate kinase III  29.6 
 
 		 451 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135381  hitchhiker  0.000112136 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0652  aspartate kinase III  29.15 
 
 		 451 aa  149  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000108783  normal  0.0665157 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3658  aspartate kinase III  29.37 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  hitchhiker  0.000000794712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2982  aspartate kinase III  29.31 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0680  aspartate kinase III  29.31 
 
 		 451 aa  145  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2189  aspartate kinase  28.54 
 
 		 446 aa  145  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1494  aspartate kinase  27.21 
 
 		 804 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  31.76 
 
 		 818 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.85 
 
 		 819 aa  145  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  27.15 
 
 		 437 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0817  aspartate kinase III  28.54 
 
 		 450 aa  142  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.784951  hitchhiker  0.0000472432 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3721  aspartate kinase  25.47 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14309  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  31.86 
 
 		 823 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.09 
 
 		 815 aa  140  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  27.17 
 
 		 878 aa  139  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5565  aspartate kinase  29.4 
 
 		 414 aa  139  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  33.66 
 
 		 468 aa  138  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  32.33 
 
 		 815 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  31.97 
 
 		 462 aa  137  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0779  aspartate kinase III  31.77 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705118  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3425  aspartate kinase III  29.57 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000055532  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2542  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.86 
 
 		 815 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.573411  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3764  aspartate kinase III  29.15 
 
 		 450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226925  hitchhiker  0.00174261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.14 
 
 		 818 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  33.64 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0577  aspartate kinase  34.33 
 
 		 468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.798745  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00814  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.31 
 
 		 835 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661327  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1820  aspartate kinase  27.66 
 
 		 466 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000320312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1011  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  32.28 
 
 		 864 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834007  normal  0.825142 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1642  aspartate kinase  34.23 
 
 		 468 aa  130  6e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0142  aspartate kinase  30.77 
 
 		 463 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0259  aspartate kinase  33.89 
 
 		 468 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.889739  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1754  aspartate kinase  28.96 
 
 		 467 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6874  aspartate kinase  27.34 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.52096 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1138  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.6 
 
 		 822 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.592327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1209  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.6 
 
 		 822 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0142  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.23 
 
 		 820 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000979597  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  30.87 
 
 		 814 aa  128  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02310  lysine-sensitive aspartokinase III (aspartate kinase III)  28.94 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1139  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.6 
 
 		 822 aa  128  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0421485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.81 
 
 		 822 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0346  aspartate kinase  33.11 
 
 		 465 aa  127  5e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3415  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.28 
 
 		 822 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1304  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.81 
 
 		 822 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3086  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.81 
 
 		 822 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1227  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.81 
 
 		 822 aa  126  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>