More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1219 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1219  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 127 aa  256  9e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0546  50S ribosomal protein L21  62.04 
 
 		 125 aa  149  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.797302  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2127  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 121 aa  145  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.389677 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13981  50S ribosomal protein L21  51.18 
 
 		 170 aa  143  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.510472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  53.12 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05411  50S ribosomal protein L21  57.27 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17711  50S ribosomal protein L21  52.03 
 
 		 139 aa  140  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0269393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0915  50S ribosomal protein L21  55.36 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1516  50S ribosomal protein L21  63.71 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00385929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15451  50S ribosomal protein L21  50.42 
 
 		 166 aa  131  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.946865  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1442  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15301  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15051  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645106  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0423  50S ribosomal protein L21  61.21 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3346  50S ribosomal protein L21  56.3 
 
 		 123 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2771  50S ribosomal protein L21  56.3 
 
 		 123 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0693096 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3466  50S ribosomal protein L21  59.46 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.302782 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  49 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3243  50S ribosomal protein L21P  55.46 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  50 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  44.23 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 102 aa  93.6  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2481  ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726202  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  45 
 
 		 104 aa  90.9  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35695  predicted protein  45 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00157313  normal  0.015942 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  43.48 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1325  50S ribosomal protein L21  42.61 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000243577  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1036  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 106 aa  88.2  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0850957  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  41.74 
 
 		 134 aa  87.4  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  43 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  41.58 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  41 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  42 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  43 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  84.3  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 104 aa  84  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  45 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  37 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  40.59 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  37 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  38 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3033  ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  39.42 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  80.1  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  37 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>