102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1061 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1061  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  619  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000109934  normal  0.0587349 
 
 
 
NC_011884  Cyan7425_5125  hypothetical protein  51.15 
 
 
310 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2950  hypothetical protein  49.69 
 
 
334 aa  302  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0249458  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4493  hypothetical protein  48.73 
 
 
319 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4532  hypothetical protein  48.73 
 
 
319 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4593  hypothetical protein  45.45 
 
 
311 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00114736  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0198  hypothetical protein  43.52 
 
 
313 aa  265  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202809  hitchhiker  0.00402229 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  42.9 
 
 
320 aa  248  7e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  40.39 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  40 
 
 
339 aa  243  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0619  hypothetical protein  39.17 
 
 
341 aa  238  6.999999999999999e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2183  hypothetical protein  46.47 
 
 
320 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1567a  hypothetical cytosolic protein  47.43 
 
 
335 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.203402  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1739  hypothetical cytosolic protein  41.42 
 
 
312 aa  236  4e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2414  hypothetical protein  39.47 
 
 
307 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1248  hypothetical protein  45.23 
 
 
336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2152  hypothetical cytosolic protein  39.37 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3938  hypothetical protein  40.65 
 
 
311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0026  hypothetical protein  39.05 
 
 
325 aa  230  3e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1336  hypothetical protein  44.77 
 
 
316 aa  227  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1034  hypothetical protein  43.63 
 
 
321 aa  224  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0991  hypothetical protein  43.24 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1509  hypothetical protein  45.61 
 
 
320 aa  219  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.055753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1015  hypothetical protein  45.19 
 
 
324 aa  219  6e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1962  hypothetical protein  39.32 
 
 
327 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1558  hypothetical protein  43.93 
 
 
316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0762  hypothetical protein  44.49 
 
 
317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00138696  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0038  hypothetical protein  41.48 
 
 
324 aa  207  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1916  hypothetical protein  42.86 
 
 
252 aa  204  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0686  hypothetical protein  43.93 
 
 
312 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000261491  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1243  hypothetical protein  40.31 
 
 
310 aa  195  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429592  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1410  hypothetical protein  37.9 
 
 
235 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4692  hypothetical protein  38.25 
 
 
293 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.824863  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1193  hypothetical protein  31.5 
 
 
317 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1222  hypothetical protein  31.27 
 
 
313 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1399  hypothetical protein  36.36 
 
 
211 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0266105  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2348  hypothetical protein  38.02 
 
 
201 aa  123  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2345  hypothetical protein  37.57 
 
 
206 aa  120  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.387086  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3970  hypothetical protein  29.57 
 
 
317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.257716  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3426  hypothetical protein  31.99 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2274  hypothetical protein  30.77 
 
 
315 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0681  hypothetical protein  31.35 
 
 
304 aa  109  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000573749  unclonable  0.0000000126403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  30.41 
 
 
318 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1062  hypothetical protein  66.22 
 
 
75 aa  93.6  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144683  normal  0.0450083 
 
 
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  28.7 
 
 
330 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0564  hypothetical protein  28.3 
 
 
302 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1063  hypothetical protein  58.54 
 
 
82 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000299029  normal  0.0436362 
 
 
 
NC_007644  Moth_0174  hypothetical protein  28.43 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.384261  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  27.73 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5809  hypothetical protein  53.33 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3368  hypothetical protein  26.56 
 
 
297 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0368  hypothetical protein  27.74 
 
 
287 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.730391  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0748  hypothetical protein  31.25 
 
 
134 aa  60.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000803284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1306  hypothetical protein  28.52 
 
 
283 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3206  hypothetical protein  26.6 
 
 
284 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4405  hypothetical protein  51.85 
 
 
305 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2187  hypothetical protein  30.16 
 
 
290 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3814  hypothetical protein  49.02 
 
 
261 aa  58.9  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.04819  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3554  hypothetical protein  48.21 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5391  hypothetical protein  41.43 
 
 
70 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.566383  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2559  hypothetical protein  48.21 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.789765  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3564  hypothetical protein  36.9 
 
 
94 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0951658  normal  0.295077 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1243  hypothetical protein  44.83 
 
 
288 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0167  hypothetical protein  50.91 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1515  hypothetical protein  43.33 
 
 
275 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5057  hypothetical protein  45 
 
 
86 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206595 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2808  hypothetical protein  41.67 
 
 
85 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.118486  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1542  hypothetical protein  43.33 
 
 
275 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.966764  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  24.71 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3060  hypothetical protein  26.24 
 
 
280 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4873  hypothetical protein  48.08 
 
 
286 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2793  hypothetical protein  26.85 
 
 
301 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1249  hypothetical protein  31.62 
 
 
154 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4509  hypothetical protein  42.11 
 
 
303 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1349  hypothetical protein  30.41 
 
 
166 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072063  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4879  hypothetical protein  28.57 
 
 
196 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  30 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  36.07 
 
 
326 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  36.07 
 
 
382 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0248  hypothetical cytosolic protein  28.3 
 
 
138 aa  50.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1946  hypothetical protein  28.3 
 
 
138 aa  50.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000308535  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5118  hypothetical protein  29.96 
 
 
291 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  28.19 
 
 
300 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3810  hypothetical protein  38.33 
 
 
274 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00863066  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1818  hypothetical protein  47.62 
 
 
280 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.937622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1071  hypothetical protein  40 
 
 
294 aa  49.3  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.05102 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1724  hypothetical protein  38.33 
 
 
280 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.377801  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3371  hypothetical protein  52.38 
 
 
284 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4234  hypothetical protein  35.19 
 
 
59 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000176119 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3467  hypothetical protein  36.84 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432253  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1883  hypothetical protein  45 
 
 
80 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  37.29 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  35.82 
 
 
343 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  27.56 
 
 
304 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2641  hypothetical protein  56.41 
 
 
41 aa  46.2  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1699  hypothetical protein  36.21 
 
 
288 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  29.37 
 
 
340 aa  46.2  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  31.67 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2442  hypothetical protein  35.85 
 
 
296 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  hitchhiker  0.000000122281 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0749  hypothetical protein  33.9 
 
 
122 aa  43.5  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000564338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>