45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0564 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0564  ATPase-like  100 
 
 		 902 aa  1879    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0661178  normal  0.572377 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  22.69 
 
 		 1145 aa  87.8  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  23.08 
 
 		 775 aa  76.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  22.87 
 
 		 775 aa  76.3  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  22.51 
 
 		 769 aa  68.2  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  21.66 
 
 		 1172 aa  67.8  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  21.66 
 
 		 1172 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  24.26 
 
 		 632 aa  67  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  22.79 
 
 		 828 aa  64.7  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  22.29 
 
 		 771 aa  63.9  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  24.06 
 
 		 636 aa  63.5  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  23.3 
 
 		 777 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3238  hypothetical protein  26.15 
 
 		 947 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0772641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  23.3 
 
 		 777 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  23.3 
 
 		 777 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  25.96 
 
 		 531 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  22.93 
 
 		 746 aa  54.7  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  22.93 
 
 		 746 aa  54.7  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  22.27 
 
 		 776 aa  54.3  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  23.15 
 
 		 777 aa  53.9  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  20.3 
 
 		 717 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  22.71 
 
 		 524 aa  53.5  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  21.97 
 
 		 482 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  22.78 
 
 		 763 aa  52.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  22.78 
 
 		 763 aa  52.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  19.07 
 
 		 738 aa  52  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  20.69 
 
 		 857 aa  52  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  21.04 
 
 		 1285 aa  51.2  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  19.83 
 
 		 765 aa  50.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  20.05 
 
 		 717 aa  50.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  22.22 
 
 		 467 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  23.81 
 
 		 486 aa  50.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  21.83 
 
 		 777 aa  49.7  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  19.8 
 
 		 717 aa  50.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  20.66 
 
 		 760 aa  49.7  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  22.52 
 
 		 777 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  23.55 
 
 		 613 aa  48.9  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  21.32 
 
 		 874 aa  48.9  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  21.32 
 
 		 874 aa  48.9  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  20.2 
 
 		 462 aa  48.5  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  20.45 
 
 		 882 aa  48.1  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  20.4 
 
 		 759 aa  47.8  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  21.98 
 
 		 470 aa  46.2  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  19.59 
 
 		 755 aa  46.2  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2575  ATPase-like  23.77 
 
 		 355 aa  45.4  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.397649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>