47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4762 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  911    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2407  hypothetical protein  61.7 
 
 		 441 aa  501  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0240  hypothetical protein  46.56 
 
 		 440 aa  347  2e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  44.63 
 
 		 513 aa  325  9e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  44.39 
 
 		 514 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1798  hypothetical protein  42.11 
 
 		 508 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.113847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1519  hypothetical protein  41.89 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1517  hypothetical protein  42.21 
 
 		 473 aa  316  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  40.54 
 
 		 514 aa  290  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0904  hypothetical protein  39.74 
 
 		 498 aa  290  4e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1078  hypothetical protein  37.88 
 
 		 472 aa  237  4e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0113368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01144  hypothetical protein  29.93 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  26.68 
 
 		 580 aa  102  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  26.67 
 
 		 511 aa  100  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  25.36 
 
 		 514 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  25.36 
 
 		 514 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  26.75 
 
 		 502 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  25.49 
 
 		 512 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  28.07 
 
 		 463 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  26.14 
 
 		 471 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  25.67 
 
 		 510 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  25.49 
 
 		 512 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  24.88 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  27.17 
 
 		 530 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  26.14 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  26.29 
 
 		 529 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  25.96 
 
 		 477 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  26.06 
 
 		 553 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  25.06 
 
 		 509 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  25.88 
 
 		 561 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  24.58 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  24.58 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  26.41 
 
 		 564 aa  61.6  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  25.42 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  25.42 
 
 		 488 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  25.42 
 
 		 488 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  26.42 
 
 		 491 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  26.97 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  25.93 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  28.01 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  25.06 
 
 		 480 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  25.64 
 
 		 453 aa  50.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5591  hypothetical protein  23.51 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52477 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  24.54 
 
 		 572 aa  47  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  23.88 
 
 		 455 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0568  hypothetical protein  28.89 
 
 		 627 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2333  hypothetical protein  26.45 
 
 		 427 aa  43.9  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179446  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>