39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2421 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2421  peptidase M61 domain-containing protein  100 
 
 		 599 aa  1191    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.140627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2037  peptidase M61 domain protein  23.6 
 
 		 618 aa  57  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1038  peptidase M61  23.93 
 
 		 600 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2724  protease, putative  24.21 
 
 		 588 aa  55.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1653  peptidase M61 domain-containing protein  23.81 
 
 		 592 aa  54.7  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.283043  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1447  protease, putative  28.42 
 
 		 587 aa  53.9  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0105  peptidase M61 domain-containing protein  25.56 
 
 		 642 aa  53.9  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.953091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1797  peptidase M61 domain-containing protein  26.19 
 
 		 588 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2489  peptidase M61 domain protein  26.19 
 
 		 588 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2385  peptidase M61 domain-containing protein  24.6 
 
 		 588 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2315  peptidase M61 domain-containing protein  24.6 
 
 		 588 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1433  peptidase M61 domain protein  24.89 
 
 		 591 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1833  peptidase M61 domain-containing protein  25.4 
 
 		 588 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.180566  normal  0.794619 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2508  peptidase M61 domain-containing protein  24.21 
 
 		 588 aa  51.2  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000376919 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0883  peptidase M61 domain-containing protein  27.16 
 
 		 597 aa  51.2  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1789  peptidase M61 domain-containing protein  26.19 
 
 		 588 aa  50.8  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119703  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3734  peptidase M61 domain protein  24.84 
 
 		 596 aa  50.4  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3762  peptidase M61 domain-containing protein  22.88 
 
 		 594 aa  50.4  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112026  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3297  peptidase M61 domain protein  23.01 
 
 		 601 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  0.542391 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1394  PDZ/DHR/GLGF  24.85 
 
 		 587 aa  48.5  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2803  peptidase M61 domain protein  23.01 
 
 		 601 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0462  peptidase M61 domain-containing protein  24.45 
 
 		 592 aa  48.1  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3368  peptidase M61 domain-containing protein  26.83 
 
 		 600 aa  48.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0145  peptidase M61  23.65 
 
 		 594 aa  47.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4157  peptidase M61 domain protein  26.52 
 
 		 497 aa  47.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4782  peptidase M61 domain-containing protein  26.67 
 
 		 635 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0264  peptidase M61 domain-containing protein  25.67 
 
 		 578 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.023247 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0088  hypothetical protein  24.79 
 
 		 695 aa  45.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3590  PDZ domain-containing protein  27.27 
 
 		 609 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3582  peptidase  27.36 
 
 		 612 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.955515  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3622  peptidase M61 domain-containing protein  25.22 
 
 		 593 aa  45.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3563  PDZ domain-containing protein  27.27 
 
 		 609 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2932  peptidase M61 domain protein  25.83 
 
 		 593 aa  44.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500697  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3920  peptidase M61 domain protein  22.38 
 
 		 528 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144473  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2890  hypothetical protein  25.25 
 
 		 621 aa  44.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.633242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0651  PDZ domain-containing protein  27.27 
 
 		 609 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0947  PDZ domain-containing protein  27.27 
 
 		 609 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1917  PDZ domain-containing protein  27.27 
 
 		 609 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0526  PDZ domain-containing protein  27.27 
 
 		 609 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>