More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32890 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_32890  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
258 aa  517  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4961  enoyl-CoA hydratase  68.46 
 
 
253 aa  324  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.313807  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1272  enoyl-CoA hydratase  65.74 
 
 
265 aa  309  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5084  enoyl-CoA hydratase  65.48 
 
 
252 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.965441 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10689  enoyl-CoA hydratase  66.27 
 
 
263 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.11 
 
 
260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0289  enoyl-CoA hydratase  63.05 
 
 
257 aa  298  6e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0727939  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3941  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.29 
 
 
255 aa  297  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1006  enoyl-CoA hydratase  68.92 
 
 
254 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.451958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0978  enoyl-CoA hydratase  68.92 
 
 
254 aa  295  5e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0996  enoyl-CoA hydratase  68.92 
 
 
254 aa  295  5e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4447  enoyl-CoA hydratase  67.98 
 
 
253 aa  288  6e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0288  enoyl-CoA hydratase  70.08 
 
 
255 aa  287  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.977294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2337  enoyl-CoA hydratase  69.05 
 
 
258 aa  283  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.072463  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0387  enoyl-CoA hydratase  59.53 
 
 
266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0151  enoyl-CoA hydratase  58.37 
 
 
260 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1403  enoyl-CoA hydratase  57.85 
 
 
267 aa  278  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.930333  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01778  enoyl-CoA hydratase  59.68 
 
 
259 aa  276  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1456  enoyl-CoA hydratase  62.15 
 
 
257 aa  272  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423076  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0941  enoyl-CoA hydratase  57.77 
 
 
257 aa  271  6e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0701  enoyl-CoA hydratase  58.37 
 
 
261 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0344  enoyl-CoA hydratase  58.46 
 
 
267 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0473  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.8 
 
 
264 aa  267  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19740  enoyl-CoA hydratase  60.24 
 
 
256 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1700  enoyl-CoA hydratase  60.24 
 
 
256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183828  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6226  enoyl-CoA hydratase  62.85 
 
 
248 aa  262  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6186  enoyl-CoA hydratase  62.02 
 
 
262 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4725  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.92 
 
 
254 aa  256  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0948054  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4465  enoyl-CoA hydratase  59.6 
 
 
252 aa  252  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0779435  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1778  enoyl-CoA hydratase  57.87 
 
 
259 aa  251  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0785  enoyl-CoA hydratase  57.63 
 
 
274 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.460617 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4094  enoyl-CoA hydratase  56.6 
 
 
265 aa  249  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3276  enoyl-CoA hydratase  59.59 
 
 
245 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3896  enoyl-CoA hydratase  57.25 
 
 
274 aa  242  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2431  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 
292 aa  237  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3498  enoyl-CoA hydratase  54.07 
 
 
271 aa  225  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00180  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07560)  47.39 
 
 
296 aa  208  7e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3453  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.74 
 
 
234 aa  204  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0500  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.49 
 
 
289 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217153  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4479  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.12 
 
 
259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
273 aa  151  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.3 
 
 
269 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.63 
 
 
271 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 
264 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 
266 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  40.18 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  40.18 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  37.39 
 
 
263 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 
287 aa  135  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  40.44 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  40.44 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  42.41 
 
 
260 aa  132  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.35 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  40.67 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.41 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  41.41 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.6 
 
 
269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.11 
 
 
256 aa  129  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
277 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.23 
 
 
259 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  41.03 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  36.32 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  42.18 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  41.03 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43 
 
 
797 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3816  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.26 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.49 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.21 
 
 
256 aa  126  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  37.78 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  40.1 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  37.18 
 
 
266 aa  125  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.69 
 
 
260 aa  125  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  39.63 
 
 
259 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
259 aa  125  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  41.45 
 
 
254 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
260 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41 
 
 
256 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.11 
 
 
259 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.81 
 
 
285 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.33 
 
 
259 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  38.16 
 
 
257 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  40.31 
 
 
247 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  40.2 
 
 
257 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.09 
 
 
258 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  40.31 
 
 
247 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  40.2 
 
 
257 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  40.31 
 
 
247 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  38.97 
 
 
259 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.65 
 
 
258 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.27 
 
 
265 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  37.44 
 
 
258 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.2 
 
 
254 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.35 
 
 
259 aa  122  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  38.33 
 
 
258 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
258 aa  122  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>