36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19360 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_19360  predicted membrane protein  100 
 
 		 219 aa  424  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0604968  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0128  hypothetical protein  43.78 
 
 		 224 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0137  hypothetical protein  43.78 
 
 		 224 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0118  hypothetical protein  43.78 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  34.38 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  36.04 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1257  hypothetical protein  35.41 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  36.05 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2058  protein of unknown function DUF1275  41.14 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0018845  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7507  protein of unknown function DUF1275  37.16 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0144  protein of unknown function DUF1275  35.71 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1320  hypothetical protein  34.57 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5622  protein of unknown function DUF1275  42.06 
 
 		 264 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368186  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0326  protein of unknown function DUF1275  33.49 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  30.38 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1998  protein of unknown function DUF1275  29.41 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  29.82 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  30.6 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  29.87 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  40.35 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06861  DUF1275 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G13060)  27.88 
 
 		 256 aa  52.4  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000108871  hitchhiker  0.00598939 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  29.73 
 
 		 289 aa  52  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  27.71 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3843  protein of unknown function DUF1275  50.94 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04855  DUF1275 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07550)  28.63 
 
 		 331 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  29.45 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  37.8 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  30.3 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2918  hypothetical protein  38.04 
 
 		 273 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3053  hypothetical protein  38.04 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  31.21 
 
 		 235 aa  42.4  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  46.51 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  29.33 
 
 		 259 aa  42  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  31.21 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4207  protein of unknown function DUF1275  55.56 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249514  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3145  protein of unknown function DUF1275  37.37 
 
 		 225 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>