More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0601 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0601  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  100 
 
 
430 aa  895    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.931901  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3385  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  46.32 
 
 
451 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923359  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1045  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  51.01 
 
 
397 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0376  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  45.37 
 
 
499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0433  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  45.13 
 
 
453 aa  405  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586788  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  44.5 
 
 
817 aa  362  7.0000000000000005e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0203  aminotransferase, class III pyridoxal-phosphate dependent  37.24 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0584  aminotransferase class-III  35.21 
 
 
429 aa  269  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.660945  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0148  class III aminotransferase  34.81 
 
 
442 aa  256  5e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000391893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0343  aminotransferase class-III  33.72 
 
 
444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12390  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.37 
 
 
427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1131  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.09 
 
 
427 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4838  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.86 
 
 
427 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4784  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.86 
 
 
427 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0445996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0636  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.62 
 
 
427 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0564968  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4660  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.86 
 
 
427 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333765  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.57 
 
 
626 aa  186  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4947  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.19 
 
 
427 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4800  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.15 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09260  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.75 
 
 
429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4342  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.15 
 
 
427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.43 
 
 
427 aa  184  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.02 
 
 
429 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1835  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.48 
 
 
435 aa  183  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1229  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.16 
 
 
432 aa  182  7e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00808664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1328  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  28.33 
 
 
427 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0353724  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3774  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.48 
 
 
429 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0848252 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00650  Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.74 
 
 
426 aa  181  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1012  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.15 
 
 
428 aa  179  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000957306  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1088  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.87 
 
 
428 aa  179  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.80886  normal  0.019309 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0731  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.71 
 
 
427 aa  179  8e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.415473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0655  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.53 
 
 
428 aa  179  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05471  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.83 
 
 
413 aa  179  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4194  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.53 
 
 
429 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4205  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.53 
 
 
429 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4579  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.53 
 
 
429 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4597  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.53 
 
 
429 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4548  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.53 
 
 
429 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.23 
 
 
427 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.456141  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.18 
 
 
428 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.154612  hitchhiker  0.0000102166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0827  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.42 
 
 
423 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.215136  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0865  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.81 
 
 
425 aa  178  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.281516  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4358  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.28 
 
 
429 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.12 
 
 
430 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0256114  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4693  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.28 
 
 
429 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1199  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  28.01 
 
 
437 aa  177  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.74 
 
 
434 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.765409  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1468  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.99 
 
 
427 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.311379  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1126  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.89 
 
 
429 aa  176  5e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4552  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.28 
 
 
429 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1373  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.25 
 
 
427 aa  176  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.66 
 
 
428 aa  176  6e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1701  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.22 
 
 
433 aa  176  7e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.173155  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.88 
 
 
425 aa  176  7e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.89 
 
 
430 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1204  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.89 
 
 
430 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.632015  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05391  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.67 
 
 
433 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1280  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  34.89 
 
 
434 aa  176  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.542445  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.89 
 
 
430 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1131  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  30.56 
 
 
430 aa  176  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.856626 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2156  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.98 
 
 
432 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05101  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.67 
 
 
433 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4306  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.03 
 
 
429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0839  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.03 
 
 
427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2980  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.06 
 
 
428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.823832  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1119  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.32 
 
 
430 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1685  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.24 
 
 
425 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1432  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36 
 
 
428 aa  173  5e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0875  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.2 
 
 
430 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3139  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.04 
 
 
428 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000990553  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04841  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.02 
 
 
432 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00934887  normal  0.931792 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0694  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  27.93 
 
 
431 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0678  aminotransferase class-III  28.67 
 
 
439 aa  172  9e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.418297  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2388  aminotransferase class-III  28.34 
 
 
437 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.883188  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2577  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.59 
 
 
432 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1570  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.16 
 
 
426 aa  172  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00197478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2530  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.93 
 
 
427 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00381454  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2819  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.27 
 
 
433 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000400379  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2975  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.1 
 
 
430 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0914  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.59 
 
 
446 aa  172  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.155106  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0659  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.85 
 
 
428 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.59993 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3180  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.81 
 
 
422 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3071  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.87 
 
 
430 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.049853  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1300  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.93 
 
 
430 aa  171  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0711  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.58 
 
 
423 aa  170  4e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1419  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.65 
 
 
425 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.618734  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2893  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.87 
 
 
430 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000688047 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.87 
 
 
427 aa  169  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1789  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.72 
 
 
426 aa  169  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507749  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05401  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.88 
 
 
428 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.198771 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2421  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.97 
 
 
422 aa  168  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000486284 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0337  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.76 
 
 
427 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00652219  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1816  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.88 
 
 
432 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3551  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.97 
 
 
429 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.54 
 
 
428 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3103  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.21 
 
 
426 aa  167  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4245  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.29 
 
 
427 aa  167  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000211848  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3330  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.23 
 
 
426 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0995  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.23 
 
 
426 aa  167  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3459  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.23 
 
 
426 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>