More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0148 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0148  class III aminotransferase  100 
 
 
442 aa  918    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000391893 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0203  aminotransferase, class III pyridoxal-phosphate dependent  40.29 
 
 
429 aa  316  6e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0343  aminotransferase class-III  36.39 
 
 
444 aa  302  8.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0584  aminotransferase class-III  35.66 
 
 
429 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.660945  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3385  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  36.26 
 
 
451 aa  280  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923359  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0376  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  34.64 
 
 
499 aa  263  4.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0433  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  34.64 
 
 
453 aa  261  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586788  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0601  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  34.81 
 
 
430 aa  256  5e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.931901  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  32.79 
 
 
817 aa  234  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0678  aminotransferase class-III  33.03 
 
 
439 aa  229  7e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.418297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3156  aminotransferase class-III  32.66 
 
 
430 aa  226  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1045  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  32.49 
 
 
397 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1132  aminotransferase class-III  31.75 
 
 
416 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2388  aminotransferase class-III  28.02 
 
 
437 aa  206  9e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.883188  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2530  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.3 
 
 
427 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00381454  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1227  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.9 
 
 
422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000806301  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1789  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.19 
 
 
426 aa  196  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507749  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1280  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.23 
 
 
434 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.542445  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1464  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.79 
 
 
424 aa  194  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2628  aminotransferase class-III  30.96 
 
 
436 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1126  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.31 
 
 
429 aa  190  5e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0731  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.19 
 
 
427 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.415473  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1229  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.67 
 
 
432 aa  189  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00808664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3551  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.44 
 
 
429 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0694  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.94 
 
 
426 aa  187  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.81 
 
 
427 aa  187  5e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.456141  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.91 
 
 
428 aa  186  5e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1245  aminotransferase  28.87 
 
 
675 aa  186  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1468  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.57 
 
 
427 aa  186  9e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.311379  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1162  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.94 
 
 
418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.467578  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.16 
 
 
428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1492  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.05 
 
 
429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0285  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.16 
 
 
430 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  28.9 
 
 
626 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0694  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.52 
 
 
431 aa  182  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2017  aminotransferase class-III  30.24 
 
 
424 aa  182  8.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2156  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  28.13 
 
 
432 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0417  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.45 
 
 
426 aa  182  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.237039  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0711  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.28 
 
 
423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1253  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  28.91 
 
 
431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0164  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.48 
 
 
426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1537  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  32 
 
 
456 aa  180  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.033412  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2421  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  27.82 
 
 
422 aa  180  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000486284 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0781  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.61 
 
 
429 aa  180  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3459  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.55 
 
 
426 aa  180  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3330  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.55 
 
 
426 aa  180  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0995  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.55 
 
 
426 aa  180  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.25 
 
 
426 aa  179  8e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00257803  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.25 
 
 
426 aa  179  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00152  hypothetical protein  27.25 
 
 
426 aa  179  8e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3505  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.25 
 
 
426 aa  179  8e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0155655  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0914  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.99 
 
 
446 aa  179  9e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.155106  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1835  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29 
 
 
435 aa  179  9e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0158  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.25 
 
 
426 aa  179  9e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3448  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  27.25 
 
 
426 aa  179  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0146  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.02 
 
 
426 aa  179  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3086  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.33 
 
 
436 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.156585 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0166  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.25 
 
 
426 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1965  aminotransferase class-III  30.1 
 
 
432 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.392498  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1208  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.93 
 
 
432 aa  177  3e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.25 
 
 
426 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3304  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  29.07 
 
 
429 aa  177  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1373  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.4 
 
 
427 aa  177  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.67 
 
 
433 aa  177  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2622  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.15 
 
 
445 aa  176  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0161  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.67 
 
 
433 aa  176  9e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00650  Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.84 
 
 
426 aa  176  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3180  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.37 
 
 
422 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.62 
 
 
438 aa  176  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0495  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.42 
 
 
431 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0875  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.81 
 
 
430 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0266  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.86 
 
 
427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.23 
 
 
426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0221  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.23 
 
 
426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00426685  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0865  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  27.45 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.281516  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.27 
 
 
427 aa  174  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3103  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.23 
 
 
426 aa  173  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0223  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.46 
 
 
426 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.01485  normal  0.360359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2033  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.73 
 
 
434 aa  173  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0686  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.37 
 
 
426 aa  172  9e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27 
 
 
426 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00212628  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1131  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  28.83 
 
 
430 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.856626 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0185  aminotransferase class-III  29.05 
 
 
448 aa  172  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0485  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.57 
 
 
431 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3565  aminotransferase class-III  30.54 
 
 
435 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.223934 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1432  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.17 
 
 
428 aa  171  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.56 
 
 
430 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0256114  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.66 
 
 
430 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.88 
 
 
429 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2577  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.05 
 
 
432 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002591  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.21 
 
 
431 aa  170  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00474755  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1328  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  27.38 
 
 
427 aa  170  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0353724  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2747  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.21 
 
 
452 aa  169  7e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1012  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.65 
 
 
428 aa  169  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000957306  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.33 
 
 
430 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1204  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.33 
 
 
430 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.632015  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1975  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  29.6 
 
 
439 aa  169  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102395  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1024  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.89 
 
 
434 aa  169  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.33 
 
 
430 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2975  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.56 
 
 
430 aa  169  9e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>