More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2961 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  100 
 
 		 334 aa  671    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  58.44 
 
 		 343 aa  351  8e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2488  glycosyl transferase family 2  59.19 
 
 		 335 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468454  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  55.27 
 
 		 326 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  59.75 
 
 		 330 aa  322  5e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  55.45 
 
 		 342 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  56.8 
 
 		 321 aa  308  8e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3452  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  59.18 
 
 		 318 aa  305  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.0411609 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0338  glycosyl transferase family 2  54.06 
 
 		 324 aa  272  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0337  glycosyl transferase family 2  55.25 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0167  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  52.55 
 
 		 315 aa  262  6.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  46.37 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  50.36 
 
 		 299 aa  235  8e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2860  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.47 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  46.5 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  47.08 
 
 		 359 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2312  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  47.21 
 
 		 335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  46.65 
 
 		 312 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  44.9 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1142  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  42 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5332  glycosyl transferase family 2  50.19 
 
 		 329 aa  219  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  43.61 
 
 		 324 aa  219  6e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  43.99 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  43.99 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  43.99 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1165  glycosyl transferase family 2  46.23 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 		 510 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09131  hypothetical protein  27.88 
 
 		 395 aa  95.9  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.554848  hitchhiker  0.00082103 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0245  hypothetical protein  27.88 
 
 		 395 aa  95.9  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 		 522 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0837  hypothetical protein  27.36 
 
 		 408 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08961  hypothetical protein  27.27 
 
 		 408 aa  89.4  8e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.359171  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06741  hypothetical protein  28.57 
 
 		 402 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0870482  normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10451  hypothetical protein  29.05 
 
 		 408 aa  86.3  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2244  hypothetical protein  35.1 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08941  hypothetical protein  27.48 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2607  hypothetical protein  34.62 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166847  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  31.98 
 
 		 209 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1772  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0824  glycosyl transferase family protein  42.98 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.216941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  38.5 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2847  hypothetical protein  26.97 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663115  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02160  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25.2 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409645  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  40.48 
 
 		 693 aa  72.8  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1195  glycosyltransferase-like protein  30.53 
 
 		 365 aa  72.4  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.809596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 206 aa  72  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2340  hypothetical protein  25.5 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4062  hypothetical protein  30.47 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1685  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.908588  hitchhiker  0.00379696 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1890  hypothetical protein  25.17 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116319  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3045  glycosyltransferase-like protein  33.69 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2601  hypothetical protein  29.11 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.625325  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0654  hypothetical protein  29.2 
 
 		 391 aa  69.3  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0507  hypothetical protein  26.76 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551714  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1821  hypothetical protein  23.7 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117561  normal  0.653656 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1456  glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.443232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1452  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591361 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0773  hypothetical protein  22.39 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0737  hypothetical protein  28.42 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  41.07 
 
 		 222 aa  67  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  28.51 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 		 230 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  43.88 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2129  hypothetical protein  28.17 
 
 		 408 aa  67  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2052  hypothetical protein  25.5 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2163  cell wall biogenesis glycosyltransferase  24.46 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.407321  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  35 
 
 		 365 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 		 231 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  33.14 
 
 		 242 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.96 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  41.05 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3209  hypothetical protein  26.59 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2567  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25.33 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0206766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2574  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25.33 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00191842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2581  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25.33 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000562395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  30.92 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  29.06 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  38.95 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  26.46 
 
 		 410 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  36.3 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2620  glycosyltransferase-like protein  30.09 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  36.03 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  28 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1612  glycosyl transferase family protein  35.44 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  38.76 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  40.62 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>