More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2527 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  61 
 
 		 719 aa  657    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  63.6 
 
 		 713 aa  692    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  58.53 
 
 		 705 aa  669    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  100 
 
 		 738 aa  1394    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  57.23 
 
 		 673 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  57.81 
 
 		 699 aa  593  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  93.87 
 
 		 730 aa  582  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.83 
 
 		 653 aa  568  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.04 
 
 		 688 aa  521  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  46.07 
 
 		 696 aa  489  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  46.09 
 
 		 637 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  39.64 
 
 		 680 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  72.07 
 
 		 788 aa  456  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  66.06 
 
 		 616 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  69.32 
 
 		 776 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  67.27 
 
 		 674 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  40.06 
 
 		 653 aa  409  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  69.21 
 
 		 680 aa  412  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  78.12 
 
 		 690 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  39.12 
 
 		 614 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  64.78 
 
 		 622 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  64.78 
 
 		 622 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  64.78 
 
 		 622 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  63.53 
 
 		 638 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  64.37 
 
 		 626 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  53.48 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  58.19 
 
 		 364 aa  368  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  41.48 
 
 		 749 aa  360  5e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  64.44 
 
 		 629 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  64.48 
 
 		 618 aa  352  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  49.48 
 
 		 669 aa  344  4e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  48.32 
 
 		 356 aa  340  8e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  55.65 
 
 		 346 aa  339  9e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  56.23 
 
 		 372 aa  339  9e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.75 
 
 		 337 aa  339  9.999999999999999e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  50 
 
 		 337 aa  332  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.04 
 
 		 379 aa  326  9e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.15 
 
 		 374 aa  323  7e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.92 
 
 		 362 aa  322  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.82 
 
 		 358 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.56 
 
 		 405 aa  322  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.82 
 
 		 358 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.17 
 
 		 370 aa  320  5e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.69 
 
 		 373 aa  319  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  50.62 
 
 		 346 aa  318  3e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.19 
 
 		 362 aa  317  4e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.76 
 
 		 364 aa  315  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.17 
 
 		 377 aa  315  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  51.35 
 
 		 351 aa  313  7.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  51.53 
 
 		 345 aa  313  7.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.15 
 
 		 340 aa  313  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.27 
 
 		 394 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.69 
 
 		 336 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.37 
 
 		 357 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  49.85 
 
 		 362 aa  310  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.54 
 
 		 384 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.85 
 
 		 369 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  53.03 
 
 		 347 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.92 
 
 		 383 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.61 
 
 		 337 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  53.37 
 
 		 365 aa  308  3e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.06 
 
 		 382 aa  308  3e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  52.04 
 
 		 334 aa  308  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.55 
 
 		 386 aa  308  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.25 
 
 		 340 aa  307  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.29 
 
 		 383 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  53.12 
 
 		 363 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.06 
 
 		 391 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  48.75 
 
 		 362 aa  304  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.07 
 
 		 674 aa  303  9e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  48.28 
 
 		 637 aa  303  1e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  48.28 
 
 		 637 aa  303  1e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.35 
 
 		 337 aa  301  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  48.6 
 
 		 362 aa  302  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  48.12 
 
 		 362 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.35 
 
 		 337 aa  300  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.65 
 
 		 340 aa  300  6e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  47.81 
 
 		 362 aa  300  7e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  48.12 
 
 		 362 aa  300  7e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  47.81 
 
 		 362 aa  300  8e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  52.04 
 
 		 334 aa  298  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.92 
 
 		 386 aa  298  3e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  52.04 
 
 		 334 aa  297  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.86 
 
 		 368 aa  297  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.68 
 
 		 341 aa  297  4e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  52.04 
 
 		 334 aa  297  6e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.05 
 
 		 340 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  50.78 
 
 		 341 aa  292  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  45.92 
 
 		 397 aa  290  6e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.27 
 
 		 348 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.97 
 
 		 665 aa  287  5.999999999999999e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  52.85 
 
 		 660 aa  281  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  55.52 
 
 		 670 aa  280  9e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  26.33 
 
 		 643 aa  280  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  51.1 
 
 		 689 aa  278  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  44.55 
 
 		 443 aa  276  7e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13860  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.97 
 
 		 351 aa  273  8.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  29 
 
 		 619 aa  272  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  68.05 
 
 		 657 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.22 
 
 		 335 aa  270  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>