More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0115 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0114  chaperone protein DnaJ  90.54 
 
 
391 aa  693    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000234642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0115  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
390 aa  768    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0364  chaperone protein DnaJ  62.63 
 
 
389 aa  445  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154064  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  58.93 
 
 
387 aa  414  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6947  chaperone protein DnaJ  56.05 
 
 
398 aa  391  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38560  chaperone protein DnaJ  55.68 
 
 
387 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0413563  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4805  chaperone protein DnaJ  56.7 
 
 
406 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  53.98 
 
 
383 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4268  chaperone protein DnaJ  52.34 
 
 
400 aa  373  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0258  chaperone protein DnaJ  53.16 
 
 
394 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0411969  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0527  chaperone protein DnaJ  53.3 
 
 
396 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  52.7 
 
 
404 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  55.88 
 
 
380 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10357  chaperone protein DnaJ  53.51 
 
 
395 aa  364  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0119746  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0451  chaperone protein DnaJ  53.8 
 
 
392 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0464  chaperone protein DnaJ  53.8 
 
 
392 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0475  chaperone protein DnaJ  53.8 
 
 
392 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5216  chaperone protein DnaJ  57.11 
 
 
404 aa  360  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0636  chaperone protein DnaJ  52.85 
 
 
393 aa  360  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37318  normal  0.150619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  51.76 
 
 
374 aa  345  8e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5469  chaperone protein DnaJ  52.39 
 
 
387 aa  343  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0231  chaperone DnaJ domain-containing protein  49.25 
 
 
393 aa  335  5.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208592  normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1962  chaperone protein DnaJ  47.73 
 
 
361 aa  316  6e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4354  chaperone DnaJ-like  50.12 
 
 
396 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4361  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 
396 aa  311  9e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  45.33 
 
 
376 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  45.33 
 
 
376 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  45.33 
 
 
376 aa  296  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  45.41 
 
 
373 aa  296  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  45.33 
 
 
376 aa  296  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  45.33 
 
 
376 aa  296  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  45.33 
 
 
376 aa  296  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  45.33 
 
 
376 aa  296  5e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  45.33 
 
 
376 aa  296  5e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  45.05 
 
 
376 aa  294  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  45.6 
 
 
379 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  45.6 
 
 
379 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  45.6 
 
 
379 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  45.6 
 
 
379 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  45.6 
 
 
379 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  42.97 
 
 
381 aa  288  8e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  42.38 
 
 
379 aa  288  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  43.44 
 
 
378 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  42.38 
 
 
379 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  43.17 
 
 
378 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  42.38 
 
 
379 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  43.63 
 
 
382 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  43.68 
 
 
377 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  43.45 
 
 
372 aa  278  1e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  40.87 
 
 
376 aa  278  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  42.28 
 
 
376 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  42.55 
 
 
378 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  42.55 
 
 
378 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  42.55 
 
 
378 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  41.89 
 
 
377 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  42.55 
 
 
378 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  42.55 
 
 
378 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  41.58 
 
 
376 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
375 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  41.58 
 
 
376 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  41.58 
 
 
376 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0800  chaperone protein DnaJ  44.24 
 
 
378 aa  276  4e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  41.58 
 
 
376 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  41.73 
 
 
376 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  41.73 
 
 
376 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  41.73 
 
 
376 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  42.58 
 
 
377 aa  276  6e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  42.55 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  42.58 
 
 
375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0488  chaperone protein DnaJ  54.94 
 
 
400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0914958  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  41.46 
 
 
376 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  40.8 
 
 
375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  42.01 
 
 
378 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  40.87 
 
 
377 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  40.26 
 
 
385 aa  273  5.000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2577  chaperone protein DnaJ  43.01 
 
 
385 aa  272  7e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00027839 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  40.81 
 
 
380 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  41.6 
 
 
376 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  41.07 
 
 
374 aa  270  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0979  chaperone DnaJ-like  41.79 
 
 
401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109475 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3219  chaperone protein DnaJ  41.14 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  41.42 
 
 
379 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  42.35 
 
 
381 aa  269  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2572  chaperone protein DnaJ  41.14 
 
 
376 aa  268  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  41.82 
 
 
380 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  41.64 
 
 
381 aa  267  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  43.87 
 
 
377 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  41.58 
 
 
373 aa  266  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 
374 aa  266  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  41.6 
 
 
376 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  40.6 
 
 
379 aa  266  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2463  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
382 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.820869  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  40.6 
 
 
379 aa  265  7e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  42.13 
 
 
377 aa  266  7e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  41.76 
 
 
378 aa  265  8e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  41.64 
 
 
378 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3318  chaperone protein DnaJ  42.13 
 
 
377 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00186939  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  40.54 
 
 
379 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1043  chaperone protein DnaJ  42.13 
 
 
377 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0054277  decreased coverage  0.0000000510426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3127  chaperone protein DnaJ  40.81 
 
 
380 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.82415  normal  0.115967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>