More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2689 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2689  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 92 aa  177  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000455611  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1558  histone family protein DNA-binding protein  92.22 
 
 		 91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000749747  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0792  histone family protein DNA-binding protein  72.22 
 
 		 93 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0846  DNA-binding protein HU  56.04 
 
 		 104 aa  100  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000034735  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000311196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  55.43 
 
 		 94 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  53.41 
 
 		 91 aa  94.4  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  54.95 
 
 		 91 aa  93.6  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  51.11 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  52.81 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09623  probable DNA-binding protein HU  52.94 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.355669  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 94 aa  90.9  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  52.17 
 
 		 94 aa  90.9  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  52.27 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  48.31 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0170  histone family protein DNA-binding protein  52.17 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000201093 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  48.31 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  48.31 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  48.31 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  48.31 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  49.44 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  48.31 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0188  histone family protein DNA-binding protein  52.17 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  51.09 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7326  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 92 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  48.31 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1957  histone-like DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000024611  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  48.31 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  48.31 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  88.2  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2673  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156087  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4682  histone family protein DNA-binding protein  47.83 
 
 		 92 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0505442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0956  DNA-binding protein HU-alpha  47.83 
 
 		 92 aa  87.8  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0083  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  54.02 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  87.8  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 92 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 95 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0238  histone family protein DNA-binding protein  55.29 
 
 		 91 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0219  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 96 aa  87  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.132966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0362  histone-like DNA-binding protein  51.69 
 
 		 91 aa  87  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  51.14 
 
 		 91 aa  87  8e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 91 aa  86.7  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0139  histone family protein DNA-binding protein  52.94 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  52.22 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1430  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000153062  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0991  DNA-binding protein HU  45.56 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.0000336504  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0798  DNA-binding protein HU 1 (DNA-binding protein II) (HB)  48.89 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.000000000041032  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1731  DNA-binding protein HU  45.56 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000000434632  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0901  DNA-binding protein HU  45.56 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.00000000000106292  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  54.55 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  47.83 
 
 		 92 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  84.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  85.5  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  84  6e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3758  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.639339  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2026  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000760647  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  46.07 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0021  DNA-binding protein HU 1 (DNA-binding protein II; HB)  51.76 
 
 		 100 aa  83.6  9e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000160012  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1967  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 92 aa  83.6  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00606172  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  46.07 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  46.07 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1544  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000007734  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0491  transcriptional regulator HU subunit beta  47.19 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0126716  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  47.19 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0493  transcriptional regulator HU subunit beta  47.19 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  46.07 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0554  transcriptional regulator HU subunit beta  47.19 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00736621  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>