More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2215 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2215  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 		 378 aa  757    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.133795  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1125  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  54.07 
 
 		 380 aa  435  1e-121  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1139  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.32 
 
 		 380 aa  300  2e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.422964 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6746  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.34 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4429  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.91 
 
 		 393 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.104303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3874  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.38 
 
 		 401 aa  122  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0228827  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1946  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.34 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4946  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  32.2 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3214  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.2 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4358  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.93 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370383  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0547  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  27.74 
 
 		 400 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2257  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.43 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3336  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.84 
 
 		 381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10599  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G05520)  30.53 
 
 		 381 aa  115  8.999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.185657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3894  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.06 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.519515  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4388  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.53 
 
 		 423 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43815  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0218  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.78 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0106637  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3855  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.94 
 
 		 370 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552694  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1862  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.46 
 
 		 370 aa  113  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.324326  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4533  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.7 
 
 		 384 aa  113  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790465  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0586  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.81 
 
 		 382 aa  112  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367627 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0433  galactonate dehydratase  28.27 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34187  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6459  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.71 
 
 		 377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0253922  hitchhiker  0.000000313702 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0122  galactonate dehydratase  26.07 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.041758  normal  0.798356 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0127  galactonate dehydratase  27.43 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.425277  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  27.78 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  27.78 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  27.78 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  27.78 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5367  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.71 
 
 		 380 aa  110  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491855 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3936  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.5 
 
 		 410 aa  109  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3370  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.18 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.90513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2591  galactonate dehydratase  27.49 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2719  galactonate dehydratase  27.49 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0390  galactonate dehydratase  28.07 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100514  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4035  galactonate dehydratase  29.04 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.16 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2615  galactonate dehydratase  26.9 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.16 
 
 		 411 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2836  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.43 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.182529  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0631  galactonate dehydratase  27.62 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3136  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.63 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.207627 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3574  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.51 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410724  normal  0.113329 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5897  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.67 
 
 		 382 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3303  galactonate dehydratase  26.2 
 
 		 382 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03575  galactonate dehydratase  26.95 
 
 		 382 aa  105  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.923731  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.95 
 
 		 382 aa  105  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4057  galactonate dehydratase  26.95 
 
 		 382 aa  105  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03519  hypothetical protein  26.95 
 
 		 382 aa  105  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3904  galactonate dehydratase  26.95 
 
 		 382 aa  105  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0011  galactonate dehydratase  26.95 
 
 		 382 aa  105  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4201  galactonate dehydratase  26.95 
 
 		 382 aa  105  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3858  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.87 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0581351  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4653  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.68 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0414891  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0656  galactonate dehydratase  26.27 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3195  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  25.54 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.49 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.08 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.601828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3479  galactonate dehydratase  26.16 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412363  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3767  galactonate dehydratase  26.16 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1145  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1050  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.52 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2580  galactonate dehydratase  26.37 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2179  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.04 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0507727  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1308  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.29 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0254  galactonate dehydratase  26.9 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2409  mandelate racemase  27.83 
 
 		 400 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0679047  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6937  galactonate dehydratase  26.85 
 
 		 381 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00161206  normal  0.967512 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2499  mandelate racemase  27.83 
 
 		 400 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2811  galactonate dehydratase  26.24 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.275596  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0742  galactonate dehydratase  25.48 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0045  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.32 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2694  galactonate dehydratase  26.9 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2383  galactonate dehydratase  26.9 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3624  galactonate dehydratase  25.32 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2464  galactonate dehydratase  26.9 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1989  galactonate dehydratase  28.04 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.217877  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2285  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.76 
 
 		 412 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4042  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.89 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4981  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.15 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.713473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1664  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.96 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0951  galactonate dehydratase  27.12 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2476  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.67 
 
 		 378 aa  103  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0918  galactonate dehydratase  26.61 
 
 		 382 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5451  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.57 
 
 		 403 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.911825  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0752  galactonate dehydratase  26.61 
 
 		 382 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4161  galactonate dehydratase  26.37 
 
 		 382 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0044  galactonate dehydratase  27.01 
 
 		 382 aa  102  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.360565 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4219  galactonate dehydratase  26.37 
 
 		 382 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4112  galactonate dehydratase  26.37 
 
 		 382 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2866  galactonate dehydratase  25.38 
 
 		 382 aa  102  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0025  galactonate dehydratase  26.37 
 
 		 382 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1095  galactonate dehydratase  26.62 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2990  galactonate dehydratase  26.37 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5182  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.68 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.028896  normal  0.168371 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0740  galactonate dehydratase  26.61 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3915  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  32.61 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4123  galactonate dehydratase  27.65 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234002  normal  0.927238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3056  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.88 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4022  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  32.61 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>