50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1776 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  100 
 
 		 81 aa  161  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  65.43 
 
 		 81 aa  108  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000249681  unclonable  0.000000335999 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  57.53 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  55.56 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  54.32 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  54.32 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  49.38 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  46.91 
 
 		 86 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  48.15 
 
 		 86 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  46.84 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  40.74 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  41.98 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  41.98 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  41.98 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  51.35 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000262554  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  45.33 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  40.74 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  45.95 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  37.04 
 
 		 84 aa  62  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  38.27 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  40.51 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  41.89 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  40 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  38.67 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  39.73 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  39.73 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  36 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000000299035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  37.84 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2255  50S ribosomal protein L23  44.3 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000014312  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  33.78 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  44.78 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  48.94 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2772  50S ribosomal protein L23  38.67 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0118683  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  35.44 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  33.78 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2063  50S ribosomal protein L23  34.57 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000000993724  normal  0.203735 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  37.18 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  33.78 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  43.06 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  44.23 
 
 		 95 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  36.67 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1617  Ribosomal protein L25/L23  34.78 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  38.33 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  37.5 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  36.67 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  36.67 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  40.48 
 
 		 97 aa  40  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>