113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9161 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9161  putative cytoplasmic protein  100 
 
 
296 aa  561  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3427  putative cytoplasmic protein  79.32 
 
 
296 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2885  hypothetical protein  67.59 
 
 
296 aa  367  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4980  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann-like domain protein  64.38 
 
 
294 aa  356  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0411301  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4488  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  68.29 
 
 
303 aa  345  6e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8384  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  62.89 
 
 
295 aa  300  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.841409  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0091  putative cytoplasmic protein  57.64 
 
 
308 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0631  Domain of unknown function DUF2520  59.17 
 
 
319 aa  294  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4719  hypothetical protein  59.36 
 
 
313 aa  272  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000278675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0159  hypothetical protein  54.11 
 
 
311 aa  270  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0210  hypothetical protein  59.52 
 
 
312 aa  266  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.163931 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0322  hypothetical protein  58.13 
 
 
297 aa  261  6.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0324  putative cytoplasmic protein  55.67 
 
 
297 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.471831  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2097  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  49.66 
 
 
327 aa  244  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35560  hypothetical protein  58.82 
 
 
298 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0380353  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4284  hypothetical protein  56.3 
 
 
314 aa  241  7.999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0716  pantoate/beta-alanine ligase  53.28 
 
 
618 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.34765 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32020  hypothetical protein  53.2 
 
 
312 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01320  hypothetical protein  46.64 
 
 
316 aa  228  9e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12870  hypothetical protein  54.32 
 
 
301 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0057272  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0459  hypothetical protein  50.2 
 
 
272 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5365  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  47.9 
 
 
315 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.937795  hitchhiker  0.00190793 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4763  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  47.04 
 
 
313 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4849  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  47.04 
 
 
313 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.300668  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5149  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  46.69 
 
 
313 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4008  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann- like domain protein  48.08 
 
 
331 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13635  hypothetical protein  48.95 
 
 
324 aa  200  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.5110900000000004e-24  normal  0.0143504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0574  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  49.46 
 
 
304 aa  189  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0437245  normal  0.0561371 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0634  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann- like domain protein  51.4 
 
 
344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.165538  normal  0.317687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1423  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  47.9 
 
 
314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.170532 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2978  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  53.6 
 
 
242 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0566  Domain of unknown function DUF2520  42.21 
 
 
313 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0367  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.06 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.288045  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0099  oxidoreductase domain-containing protein  37.63 
 
 
297 aa  146  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0140  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  35.36 
 
 
307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.14549  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0239  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.68 
 
 
290 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal  0.808086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  46.03 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0725  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.21 
 
 
285 aa  139  7e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1878  hypothetical protein  34.84 
 
 
289 aa  136  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0556  hypothetical protein  41.26 
 
 
358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0801  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  32.22 
 
 
285 aa  130  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000364861  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0159  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.85 
 
 
343 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.981834  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2608  hypothetical protein  37.01 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3372  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.69 
 
 
271 aa  125  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.403288  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_705  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.46 
 
 
290 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000337402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1787  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.08 
 
 
328 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1267  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.3 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0100  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.79 
 
 
298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.982227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1883  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  30.24 
 
 
296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1982  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.47 
 
 
282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24690  hypothetical protein  37.59 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0428  oxidoreductase domain-containing protein  29.66 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0298  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.51 
 
 
306 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0154  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  30.08 
 
 
292 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000106629  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01781  hypothetical protein  30.21 
 
 
294 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1788  hypothetical protein  26.28 
 
 
281 aa  102  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3227  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  35.85 
 
 
293 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2448  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.1 
 
 
309 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3050  hypothetical protein  30.31 
 
 
284 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2907  hypothetical protein  30.31 
 
 
284 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1455  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.06 
 
 
285 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1317  hypothetical protein  30.45 
 
 
295 aa  99.8  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0882  hypothetical protein  33.47 
 
 
312 aa  96.3  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4050  hypothetical protein  33.7 
 
 
309 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3111  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.79 
 
 
312 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.727312  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1550  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.31 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2408  hypothetical protein  36.67 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0684106  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0911  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.2 
 
 
309 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3715  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.21 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0470  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.78 
 
 
309 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0949  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.78 
 
 
309 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.522704  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4547  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.58 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3475  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.58 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128821  normal  0.109237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1101  hypothetical protein  29.74 
 
 
292 aa  89.7  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2147  hypothetical protein  29.48 
 
 
286 aa  89.4  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.687516  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0819  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.02 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3016  hypothetical protein  25.85 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.77776 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3158  hypothetical protein  31.03 
 
 
292 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0808  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.61 
 
 
309 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7461  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1853  hypothetical protein  26.44 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3719  hypothetical protein  31.3 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.562569 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3027  putative NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.6 
 
 
378 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0336  hypothetical cytosolic protein  26.1 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1523  hypothetical protein  34.03 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0111992  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2157  hypothetical protein  35.08 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0752  hypothetical protein  35.08 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2586  hypothetical protein  35.08 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328461  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3082  putative NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.08 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2027  putative NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.08 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2313  putative coenzyme F420-dependent NADP oxidoreductase  38.1 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0120565  hitchhiker  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1320  hypothetical protein  25 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3110  hypothetical protein  36.42 
 
 
212 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4572  hypothetical protein  30.34 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0023  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.82 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150455 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2173  hypothetical protein  28.32 
 
 
281 aa  62.8  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0680513  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3502  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  23.1 
 
 
267 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458858  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1643  hypothetical protein  37 
 
 
256 aa  56.2  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.639478  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1611  hypothetical protein  23.23 
 
 
256 aa  55.8  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.575841  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2892  hypothetical protein  33.96 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.392824  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6619  hypothetical protein  25.98 
 
 
266 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>