102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3082 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2157  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  728    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0752  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  728    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2586  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  728    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328461  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3027  putative NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  98.68 
 
 
378 aa  719    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3082  putative NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 
378 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2027  putative NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 
378 aa  728    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1523  hypothetical protein  93.31 
 
 
332 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0111992  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3110  hypothetical protein  98.58 
 
 
212 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4050  hypothetical protein  76.17 
 
 
309 aa  359  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0911  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  77.73 
 
 
309 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3111  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  69 
 
 
312 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.727312  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0882  hypothetical protein  67.86 
 
 
312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2448  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  74.22 
 
 
309 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0470  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  77.73 
 
 
309 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0949  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  77.73 
 
 
309 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.522704  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0808  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  76.56 
 
 
309 aa  308  9e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7461  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0819  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  76.95 
 
 
309 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_003296  RS01781  hypothetical protein  51.97 
 
 
294 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4547  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  48.52 
 
 
293 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3475  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  48.52 
 
 
293 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128821  normal  0.109237 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0725  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.05 
 
 
285 aa  142  7e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163067  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0801  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  30.47 
 
 
285 aa  134  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000364861  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0023  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  45.61 
 
 
303 aa  132  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150455 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_705  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.22 
 
 
290 aa  127  5e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000337402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3715  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.75 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0091  putative cytoplasmic protein  34.36 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3227  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  36.04 
 
 
293 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0099  oxidoreductase domain-containing protein  35.61 
 
 
297 aa  110  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3372  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.06 
 
 
271 aa  109  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.403288  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0159  hypothetical protein  34.55 
 
 
311 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3427  putative cytoplasmic protein  35.94 
 
 
296 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0100  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.43 
 
 
298 aa  106  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.982227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1455  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.29 
 
 
285 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0322  hypothetical protein  35.42 
 
 
297 aa  106  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1883  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  28.83 
 
 
296 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0140  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.22 
 
 
307 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.14549  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4488  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.42 
 
 
303 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1550  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.38 
 
 
285 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0574  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.5 
 
 
304 aa  99.4  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0437245  normal  0.0561371 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2408  hypothetical protein  33.81 
 
 
284 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0684106  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0159  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.68 
 
 
343 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.981834  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2608  hypothetical protein  32.83 
 
 
299 aa  97.1  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35560  hypothetical protein  38.22 
 
 
298 aa  96.7  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0380353  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4719  hypothetical protein  35.37 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000278675 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4980  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann-like domain protein  31.85 
 
 
294 aa  95.5  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0411301  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4284  hypothetical protein  35.51 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0324  putative cytoplasmic protein  36.08 
 
 
297 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.471831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0239  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.02 
 
 
290 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal  0.808086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2885  hypothetical protein  32.59 
 
 
296 aa  93.6  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1787  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.69 
 
 
328 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9161  putative cytoplasmic protein  35.08 
 
 
296 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3719  hypothetical protein  34.5 
 
 
315 aa  93.2  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.562569 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1788  hypothetical protein  23.97 
 
 
281 aa  93.2  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12870  hypothetical protein  36.36 
 
 
301 aa  93.2  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0057272  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1267  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.02 
 
 
291 aa  92.8  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0631  Domain of unknown function DUF2520  34.02 
 
 
319 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8384  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.5 
 
 
295 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.841409  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0459  hypothetical protein  32.64 
 
 
272 aa  89.7  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0367  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  24.33 
 
 
289 aa  89.7  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.288045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0154  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  30.98 
 
 
292 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000106629  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0210  hypothetical protein  31.71 
 
 
312 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.163931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0716  pantoate/beta-alanine ligase  33.68 
 
 
618 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.34765 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32020  hypothetical protein  33.33 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01320  hypothetical protein  30.32 
 
 
316 aa  84  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4572  hypothetical protein  31.42 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3158  hypothetical protein  28.95 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0298  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.17 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2097  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.16 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0634  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann- like domain protein  35.16 
 
 
344 aa  77  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.165538  normal  0.317687 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1101  hypothetical protein  28.19 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1317  hypothetical protein  27.4 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3016  hypothetical protein  21.34 
 
 
297 aa  75.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.77776 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0336  hypothetical cytosolic protein  25.95 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1853  hypothetical protein  25.95 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0428  oxidoreductase domain-containing protein  23.12 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1878  hypothetical protein  28.57 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4008  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann- like domain protein  30.6 
 
 
331 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5365  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  28.14 
 
 
315 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.937795  hitchhiker  0.00190793 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0566  Domain of unknown function DUF2520  30.22 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1423  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  30.05 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.170532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4763  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  29.38 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4849  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  29.38 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.300668  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5149  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  29.38 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2978  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.06 
 
 
242 aa  64.3  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1982  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  21.72 
 
 
282 aa  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0556  hypothetical protein  30.3 
 
 
358 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13635  hypothetical protein  29.81 
 
 
324 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.5110900000000004e-24  normal  0.0143504 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3050  hypothetical protein  24.34 
 
 
284 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2173  hypothetical protein  28.21 
 
 
281 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0680513  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2907  hypothetical protein  23.81 
 
 
284 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0659  hypothetical protein  26.73 
 
 
270 aa  53.5  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.599675 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2147  hypothetical protein  26.73 
 
 
286 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.687516  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2952  hypothetical protein  22.89 
 
 
253 aa  53.1  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.588576  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1098  hypothetical protein  25.56 
 
 
264 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3502  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  22.35 
 
 
267 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458858  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1022  hypothetical protein  25.57 
 
 
264 aa  50.8  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000881326  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1611  hypothetical protein  24.21 
 
 
256 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.575841  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6619  hypothetical protein  28.44 
 
 
266 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24690  hypothetical protein  30.93 
 
 
308 aa  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3313  hypothetical protein  27.08 
 
 
259 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>