64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24690 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_24690  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  580  1.0000000000000001e-165  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0159  hypothetical protein  39.86 
 
 
311 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0322  hypothetical protein  40.55 
 
 
297 aa  139  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0631  Domain of unknown function DUF2520  38.49 
 
 
319 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3427  putative cytoplasmic protein  37.59 
 
 
296 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2885  hypothetical protein  36.59 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12870  hypothetical protein  37.93 
 
 
301 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0057272  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01320  hypothetical protein  37.14 
 
 
316 aa  125  6e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0091  putative cytoplasmic protein  36.43 
 
 
308 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4980  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann-like domain protein  37.39 
 
 
294 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0411301  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2097  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.2 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0210  hypothetical protein  36.61 
 
 
312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.163931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0324  putative cytoplasmic protein  40.41 
 
 
297 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.471831  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35560  hypothetical protein  37.8 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0380353  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4849  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  35.87 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.300668  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4763  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  35.87 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5149  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  35.51 
 
 
313 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0716  pantoate/beta-alanine ligase  36.77 
 
 
618 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.34765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4488  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.31 
 
 
303 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9161  putative cytoplasmic protein  35.71 
 
 
296 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4719  hypothetical protein  38.11 
 
 
313 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000278675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5365  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  34.62 
 
 
315 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.937795  hitchhiker  0.00190793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8384  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.48 
 
 
295 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.841409  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32020  hypothetical protein  38.42 
 
 
312 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1423  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  36.33 
 
 
314 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.170532 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0566  Domain of unknown function DUF2520  34.43 
 
 
313 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0574  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.94 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0437245  normal  0.0561371 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13635  hypothetical protein  34.13 
 
 
324 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.5110900000000004e-24  normal  0.0143504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4008  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann- like domain protein  32.2 
 
 
331 aa  89.4  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4284  hypothetical protein  35.56 
 
 
314 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0634  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann- like domain protein  36.51 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.165538  normal  0.317687 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2978  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.95 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0099  oxidoreductase domain-containing protein  32.08 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0459  hypothetical protein  29.77 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2608  hypothetical protein  29.39 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0154  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  27.17 
 
 
292 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000106629  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0882  hypothetical protein  31.72 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3111  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.9 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.727312  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0159  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  24.51 
 
 
343 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.981834  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0239  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  24.8 
 
 
290 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal  0.808086 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1878  hypothetical protein  25.4 
 
 
289 aa  59.7  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0556  hypothetical protein  33.98 
 
 
358 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0140  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.2 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.14549  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1787  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  25.42 
 
 
328 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1267  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.73 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01781  hypothetical protein  30.48 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1788  hypothetical protein  21.07 
 
 
281 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1883  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  25.29 
 
 
296 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0447  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.62 
 
 
251 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481613  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.21 
 
 
317 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  39.39 
 
 
236 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4547  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.45 
 
 
293 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3475  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.45 
 
 
293 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128821  normal  0.109237 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0725  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  23.62 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163067  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0801  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  28.28 
 
 
285 aa  43.1  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000364861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2448  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.98 
 
 
309 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2027  putative NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.94 
 
 
378 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3082  putative NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.94 
 
 
378 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2586  hypothetical protein  34.94 
 
 
378 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328461  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0752  hypothetical protein  34.94 
 
 
378 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2157  hypothetical protein  34.94 
 
 
378 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0023  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.13 
 
 
303 aa  42.7  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150455 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_705  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.85 
 
 
290 aa  42.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000337402  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3227  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  29.15 
 
 
293 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>