34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8050 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8049  hypothetical protein  59.15 
 
 		 891 aa  711    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8050  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  100 
 
 		 852 aa  1634    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3549  protein of unknown function DUF214  39.33 
 
 		 881 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4158  protein of unknown function DUF214  31.99 
 
 		 934 aa  254  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.434869  normal  0.0912085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4811  protein of unknown function DUF214  30.31 
 
 		 998 aa  241  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.661642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3175  protein of unknown function DUF214  31.94 
 
 		 910 aa  221  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.612521  normal  0.0435773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1413  hypothetical protein  34.81 
 
 		 926 aa  206  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.232958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0699  protein of unknown function DUF214  33.23 
 
 		 934 aa  197  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0830  protein of unknown function DUF214  29.41 
 
 		 958 aa  113  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.800045 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  22.25 
 
 		 857 aa  65.1  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  23.34 
 
 		 858 aa  65.1  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  23.02 
 
 		 856 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06210  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.77 
 
 		 933 aa  59.3  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  33.14 
 
 		 871 aa  55.8  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  25.81 
 
 		 842 aa  55.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  28 
 
 		 854 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  32.03 
 
 		 859 aa  52.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  36.22 
 
 		 853 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  27.68 
 
 		 930 aa  50.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  29.66 
 
 		 849 aa  49.3  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  30.34 
 
 		 849 aa  49.3  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  26.47 
 
 		 885 aa  49.7  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  32.56 
 
 		 843 aa  48.9  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  31.6 
 
 		 866 aa  48.5  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  28.02 
 
 		 841 aa  48.5  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  29.38 
 
 		 880 aa  47  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  26.86 
 
 		 838 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  34.72 
 
 		 848 aa  45.8  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  27.71 
 
 		 836 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0100  protein of unknown function DUF214  35.44 
 
 		 1193 aa  46.2  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0334  protein of unknown function DUF214  27.19 
 
 		 941 aa  45.8  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.530518  hitchhiker  0.0000549339 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  27.45 
 
 		 419 aa  45.4  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  31.75 
 
 		 858 aa  44.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  26.14 
 
 		 896 aa  44.7  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>