167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3415 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3415  metalloprotease-like protein  100 
 
 
353 aa  722    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154601  normal  0.658534 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1876  hypothetical protein  51.87 
 
 
372 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.425514  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0930  metalloprotease-like protein  31.05 
 
 
341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52614  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2920  hypothetical protein  27.85 
 
 
322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0662  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.86 
 
 
324 aa  126  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6735  metalloprotease-like protein  30 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331634  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4325  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.69 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2919  metalloprotease  28.62 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4326  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.54 
 
 
331 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0857  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  33.64 
 
 
302 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1467  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.35 
 
 
358 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06840  predicted metalloprotease  32.39 
 
 
319 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.219653  normal  0.038026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4616  metalloprotease-like protein  30.04 
 
 
258 aa  99.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10350  predicted metalloprotease  28.69 
 
 
322 aa  95.9  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.996596  normal  0.0302489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0858  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.84 
 
 
347 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0459016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4034  metalloprotease-like protein  28.99 
 
 
266 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096293  normal  0.0588825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6736  metalloprotease-like protein  29.32 
 
 
259 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal  0.186259 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.36 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1749  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.8 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.639669  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.43 
 
 
310 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  25.11 
 
 
299 aa  79.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.27 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.94 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1074  hypothetical protein  28.77 
 
 
303 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.22 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.01 
 
 
311 aa  77  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25770  predicted metalloprotease  27.31 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.6 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4041  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.92 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000295256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1219  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.5 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  26.32 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  26.87 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4637  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.4 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191451  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2846  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  24.28 
 
 
517 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1265  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.63 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2711  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  23.98 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2086  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.79 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.19 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3451  hypothetical protein  25.74 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1201  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.36 
 
 
319 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2719  zinc protease  26.67 
 
 
287 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.884525  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2679  zinc protease  26.67 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2631  zinc protease  26.67 
 
 
287 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3506  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  24 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2745  zinc protease  26.67 
 
 
287 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592779  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2852  zinc protease  25.68 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3868  zinc metallopeptidase putative  25.57 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1207  hypothetical protein  25.68 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2970  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.37 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0222761 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02367  hypothetical protein  26.55 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1194  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.55 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3697  hypothetical protein  26.55 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02329  hypothetical protein  26.55 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2606  hypothetical protein  26.55 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1201  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.55 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117986  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2622  hypothetical protein  26.55 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2971  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  26.22 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  24.75 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  24.75 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  28.02 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3224  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  26.32 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  27.23 
 
 
284 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2333  hypothetical protein  26.32 
 
 
281 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118308  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3879  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.22 
 
 
295 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2847  hypothetical protein  26.11 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1850  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.32 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0442  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.85 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.893193 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2755  hypothetical protein  26.11 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  24.24 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2264  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  24.89 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2602  hypothetical protein  24.32 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.220369 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.32 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1710  zinc binding 2  26.87 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0910  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.59 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0387284 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.74 
 
 
298 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  27.32 
 
 
297 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0828  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  24.38 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  27.32 
 
 
297 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  25.12 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  24.76 
 
 
296 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.86 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.62 
 
 
296 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.86 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3535  hypothetical protein  29.03 
 
 
291 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.995239 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4616  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  24.34 
 
 
282 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27 
 
 
296 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0447  putative neutral zinc metallopeptidase  25 
 
 
282 aa  63.9  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00964466  normal  0.614722 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4365  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  24.34 
 
 
308 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.0204916 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2154  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.09 
 
 
292 aa  63.9  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214921  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3584  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.94 
 
 
292 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4783  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.94 
 
 
292 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383478  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2312  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  24.12 
 
 
292 aa  63.5  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000120651  normal  0.307835 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5500  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.94 
 
 
292 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0929  hypothetical protein  26.42 
 
 
293 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1643  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.29 
 
 
285 aa  63.2  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18536  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3563  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.45 
 
 
293 aa  62.8  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4250  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  24 
 
 
279 aa  62.8  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3296  hypothetical protein  27.15 
 
 
320 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  24.75 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1761  metalloprotease  26 
 
 
283 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.451117  normal  0.0302656 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>