32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3135 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  48.94 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  37.65 
 
 		 129 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0724  hypothetical protein  48.75 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.262033 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1385  hypothetical protein  41.98 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4486  hypothetical protein  40.82 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0757843  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  50.67 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  37.36 
 
 		 137 aa  62  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1470  hypothetical protein  40.91 
 
 		 104 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.856687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5700  hypothetical protein  42.86 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2179  hypothetical protein  34.91 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.806217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3028  hypothetical protein  36.54 
 
 		 133 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11258  hypothetical protein  32.53 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144269 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  46.27 
 
 		 144 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3999  hypothetical protein  37.5 
 
 		 179 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397855  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1385  HesB/YadR/YfhF  41.18 
 
 		 105 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2282  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  43.08 
 
 		 320 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441037  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2321  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  43.08 
 
 		 320 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  43.08 
 
 		 320 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0783564  normal  0.0873524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3985  hypothetical protein  36.62 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4059  hypothetical protein  36.62 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1726  hypothetical protein  37.14 
 
 		 94 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.525839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0532  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2826  hypothetical protein  34.19 
 
 		 172 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00810  hypothetical protein  36.25 
 
 		 95 aa  49.3  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.471947  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2703  hypothetical protein  38.96 
 
 		 160 aa  48.9  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  35.53 
 
 		 484 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2116  hypothetical protein  32.35 
 
 		 174 aa  48.5  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1709  hypothetical protein  36.51 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289801  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0133  integral membrane protein  37.21 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2969  hypothetical protein  30.1 
 
 		 168 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413192  normal  0.144689 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2142  hypothetical protein  35 
 
 		 102 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>