26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1313 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1313  hypothetical protein  100 
 
 		 969 aa  1877    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4135  hypothetical protein  56.64 
 
 		 1002 aa  589  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8210  hypothetical protein  41.1 
 
 		 1090 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0694  hypothetical protein  60.34 
 
 		 564 aa  330  7e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0409  peptidoglycan-binding LysM  32.78 
 
 		 1385 aa  223  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.617719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6300  hypothetical protein  40.38 
 
 		 1655 aa  140  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.633429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  29.64 
 
 		 1079 aa  138  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  29.14 
 
 		 1051 aa  131  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3125  integral membrane protein  37.82 
 
 		 628 aa  127  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.435846  hitchhiker  0.000875177 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4651  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  32.84 
 
 		 1124 aa  105  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.839576 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3426  Peptidoglycan-binding LysM  30.54 
 
 		 1091 aa  104  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8747  Peptidoglycan-binding LysM  36.28 
 
 		 994 aa  92.8  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2755  Peptidoglycan-binding LysM  30.84 
 
 		 1147 aa  87.8  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00369257  normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1730  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  35.35 
 
 		 988 aa  86.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0938978  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2587  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  37.56 
 
 		 992 aa  86.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4039  transcriptional regulator, SARP family  31.11 
 
 		 1041 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.039203  normal  0.0409603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0678  transcriptional regulator, SARP family  36.71 
 
 		 1066 aa  76.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  28.14 
 
 		 1086 aa  76.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  30.43 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1367  SARP family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 963 aa  62.4  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  29.78 
 
 		 935 aa  60.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  45.16 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0425  peptidoglycan-binding LysM  35.58 
 
 		 334 aa  48.5  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0216464  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1611  peptidoglycan-binding LysM  35.58 
 
 		 334 aa  48.1  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000139366  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4963  peptidoglycan-binding LysM  31.17 
 
 		 380 aa  45.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867782  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0721  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 572 aa  44.3  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.467953 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>