45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0481 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  100 
 
 		 234 aa  447  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  56.38 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  43.98 
 
 		 250 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4837  type II secretion system protein  45.45 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  46.63 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  42.53 
 
 		 211 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  38.6 
 
 		 270 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  36.63 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  32.52 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  32.52 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  37.8 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  39.81 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  39.34 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  33.91 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  33.7 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  31.32 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5191  type II secretion system protein  36.3 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0306742  hitchhiker  0.000243657 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  41.28 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  38.02 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0593  hypothetical protein  37.57 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33350  hypothetical protein  35.71 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1524  type II secretion system protein  26.35 
 
 		 326 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437925  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1044  type II secretion system protein  26.35 
 
 		 326 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1296  Flp pilus assembly protein  28.57 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1500  type II secretion system protein  25.75 
 
 		 326 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000537712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0277  type II secretion system protein  36.17 
 
 		 251 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  23.49 
 
 		 310 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  27.88 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  25.14 
 
 		 310 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  42.17 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4664  Flp pilus assembly protein TadB  23.35 
 
 		 326 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  29.35 
 
 		 326 aa  45.4  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0519  Type II secretion system F domain protein  36.7 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0121  hypothetical protein  32.71 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1945  putative fimbriae-related outer membrane protein  22.75 
 
 		 335 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000171773  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55880  hypothetical protein  31.9 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1045  type II secretion system protein  22.75 
 
 		 306 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.506555  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1792  type II secretion system protein  22.75 
 
 		 335 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1771  type II secretion system protein  22.75 
 
 		 335 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0120  hypothetical protein  22.75 
 
 		 306 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0013193  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1775  type II secretion system protein  22.75 
 
 		 306 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628418  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0317  type II secretion system protein  37.32 
 
 		 519 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140124  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5869  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00430744  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2539  hypothetical protein  22.16 
 
 		 336 aa  42.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3371  hypothetical protein  41.51 
 
 		 276 aa  42  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>