More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0376 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0162  nucleotide sugar dehydrogenase  79.52 
 
 
420 aa  687    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.454835  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0376  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
420 aa  850    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3852  nucleotide sugar dehydrogenase  66.83 
 
 
453 aa  551  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199691  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2529  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  64.86 
 
 
439 aa  546  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1688  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  64.03 
 
 
418 aa  544  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833152  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26760  nucleotide sugar dehydrogenase  60.72 
 
 
416 aa  531  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1238  nucleotide sugar dehydrogenase  49.51 
 
 
437 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.836268  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2396  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.58 
 
 
435 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3083  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.84 
 
 
435 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0575  nucleotide sugar dehydrogenase  47.13 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0961  nucleotide sugar dehydrogenase  49.26 
 
 
435 aa  403  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7640  nucleotide sugar dehydrogenase  54.42 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3256  nucleotide sugar dehydrogenase  47.8 
 
 
437 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4504  nucleotide sugar dehydrogenase  47.2 
 
 
451 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4103  nucleotide sugar dehydrogenase  48.54 
 
 
441 aa  396  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05630  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  50.71 
 
 
417 aa  394  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2863  nucleotide sugar dehydrogenase  48.77 
 
 
447 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0023  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.55 
 
 
432 aa  389  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576582  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3843  nucleotide sugar dehydrogenase  53.83 
 
 
415 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0234219  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1309  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.94 
 
 
450 aa  385  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0281238  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1508  nucleotide sugar dehydrogenase  44.47 
 
 
434 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1553  nucleotide sugar dehydrogenase  47.82 
 
 
440 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1339  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.48 
 
 
434 aa  380  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6488  lipopolysaccharide biosynthesis protein  49.64 
 
 
419 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0335  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.14 
 
 
434 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0353  nucleotide sugar dehydrogenase  49.14 
 
 
434 aa  377  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1299  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.81 
 
 
441 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165052  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0705  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.27 
 
 
438 aa  375  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000613921  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0636  nucleotide sugar dehydrogenase  47.67 
 
 
439 aa  374  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1675  nucleotide sugar dehydrogenase  48.98 
 
 
440 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160013  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1857  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.15 
 
 
438 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1673  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.8 
 
 
435 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2833  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.6 
 
 
448 aa  364  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1384  nucleotide sugar dehydrogenase  47.82 
 
 
448 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1480  nucleotide sugar dehydrogenase  47.82 
 
 
448 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3827  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.07 
 
 
438 aa  363  3e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.10325  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3939  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.72 
 
 
505 aa  362  6e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2164  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.24 
 
 
471 aa  362  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3870  nucleotide sugar dehydrogenase  46.04 
 
 
442 aa  360  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2474  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.82 
 
 
449 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323827  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0487  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.89 
 
 
447 aa  359  4e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2807  nucleotide sugar dehydrogenase  44.1 
 
 
428 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4278  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.27 
 
 
441 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2167  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.86 
 
 
442 aa  354  1e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.959713  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5968  nucleotide sugar dehydrogenase  46.15 
 
 
445 aa  353  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0359  nucleotide sugar dehydrogenase  44.92 
 
 
439 aa  345  6e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1818  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.24 
 
 
439 aa  345  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.387792  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0509  putative polysaccharide biosynthesis protein  41.15 
 
 
413 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5249  nucleotide sugar dehydrogenase  45.69 
 
 
446 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0429  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.25 
 
 
423 aa  343  4e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4292  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.27 
 
 
440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4429  nucleotide sugar dehydrogenase  46.51 
 
 
440 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4451  nucleotide sugar dehydrogenase  46.27 
 
 
441 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6764  nucleotide sugar dehydrogenase  46 
 
 
456 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0817646  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5667  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.32 
 
 
442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0209397 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7121  nucleotide sugar dehydrogenase  45.91 
 
 
450 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168128  normal  0.1616 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6571  nucleotide sugar dehydrogenase  46.52 
 
 
443 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430897  normal  0.0960197 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4589  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.68 
 
 
465 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338579  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1229  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.89 
 
 
442 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.425997  normal  0.200381 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0487  putative polysaccharide biosynthesis protein  41.15 
 
 
413 aa  332  8e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0560  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  41.65 
 
 
414 aa  331  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0421  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  41.25 
 
 
414 aa  331  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0417  UDP-N-acetyl-D-mannosamine 6-dehydrogenase  41.01 
 
 
414 aa  331  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0240  nucleotide sugar dehydrogenase  41.87 
 
 
453 aa  329  5.0000000000000004e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.836377  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4419  nucleotide sugar dehydrogenase  43.96 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0562  putative polysaccharide biosynthesis protein  40.68 
 
 
414 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4814  putative polysaccharide biosynthesis protein  40.68 
 
 
414 aa  325  7e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0423  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.76 
 
 
414 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2856  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  37.86 
 
 
442 aa  323  5e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  hitchhiker  0.00000634421 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3559  nucleotide sugar dehydrogenase  41.33 
 
 
461 aa  281  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1225  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.14 
 
 
477 aa  269  8e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4644  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.86 
 
 
436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4732  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.86 
 
 
436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5027  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.86 
 
 
436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3288  nucleotide sugar dehydrogenase  40.91 
 
 
453 aa  258  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.178741  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1591  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.83 
 
 
431 aa  255  9e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117032  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0929  nucleotide sugar dehydrogenase  36.45 
 
 
416 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1312  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.65 
 
 
437 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3259  nucleotide sugar dehydrogenase  39.03 
 
 
426 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0638  nucleotide sugar dehydrogenase  35.95 
 
 
436 aa  244  9.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0210  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.79 
 
 
440 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.125805  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  39.38 
 
 
461 aa  242  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1854  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  36.53 
 
 
408 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0701839  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1423  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.93 
 
 
421 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.807918  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0461  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  33.41 
 
 
410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.231921  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1221  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  34.05 
 
 
410 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00366346  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1493  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.7 
 
 
423 aa  239  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887113 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0496  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.06 
 
 
449 aa  239  5.999999999999999e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1397  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  35.93 
 
 
405 aa  239  1e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1757  nucleotide sugar dehydrogenase  37.96 
 
 
437 aa  238  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1530  nucleotide sugar dehydrogenase  38.05 
 
 
449 aa  238  2e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3392  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronic acid dehydrogenase  38.1 
 
 
432 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1766  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.53 
 
 
445 aa  238  2e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000194311 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0185  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  35.13 
 
 
420 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0515  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  35.13 
 
 
420 aa  236  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4030  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  35.13 
 
 
420 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0442  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  35.9 
 
 
413 aa  236  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3187  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  39.49 
 
 
437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.878007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2214  nucleotide sugar dehydrogenase  36.04 
 
 
439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0680742  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0666  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  36.52 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.306604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>