53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2426 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2426  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2731  hypothetical protein  85.2 
 
 		 245 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1628  hypothetical protein  84.75 
 
 		 245 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936248 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2824  hypothetical protein  83.86 
 
 		 245 aa  360  9e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2748  hypothetical protein  83.86 
 
 		 245 aa  360  9e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.668199  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  56.03 
 
 		 234 aa  218  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1438  hypothetical protein  55.75 
 
 		 228 aa  218  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3050  hypothetical protein  55.46 
 
 		 229 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  40.93 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3437  hypothetical protein  41.01 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2267  hypothetical protein  32.51 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.311902 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2951  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  35.38 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2225  hypothetical protein  38.03 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1833  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  31.73 
 
 		 243 aa  91.7  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  30.84 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  30.52 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  32.54 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  28.71 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  28.91 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.54 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  31.54 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  28.71 
 
 		 455 aa  65.5  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  27.75 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  28.37 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  27.36 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.32 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  31.01 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  24.7 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.5 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  30.71 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  31.5 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  26.27 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2641  MobA-related protein  22.49 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  26.57 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02165  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  23.48 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.892695  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  28.85 
 
 		 202 aa  52.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  29.91 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  25.58 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1746  hypothetical protein  23.57 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  27.18 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.44 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  26.09 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  19.43 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  27.27 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1484  hypothetical protein  35.48 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205253  normal  0.364405 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2928  hypothetical protein  42.37 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1573  hypothetical protein  42.37 
 
 		 199 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0210508  normal  0.559729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  29.51 
 
 		 196 aa  42.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  20.19 
 
 		 202 aa  42  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  25.96 
 
 		 214 aa  42  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  26.77 
 
 		 225 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1700  hypothetical protein  27.88 
 
 		 186 aa  41.6  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.361045  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  23.85 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>