113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4729 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4729  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  100 
 
 
428 aa  854    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.257698  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  41.11 
 
 
3322 aa  229  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  41.75 
 
 
2421 aa  226  6e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  40 
 
 
2345 aa  224  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  38.24 
 
 
1998 aa  223  6e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  40.83 
 
 
3350 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.14 
 
 
658 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  38.7 
 
 
2600 aa  217  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  42.28 
 
 
2530 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  43.49 
 
 
2588 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.49 
 
 
2545 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.99 
 
 
3378 aa  210  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.99 
 
 
3480 aa  210  5e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.68 
 
 
3475 aa  206  5e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  40.84 
 
 
2984 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  35.6 
 
 
3147 aa  200  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.6 
 
 
3079 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.27 
 
 
2782 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.96 
 
 
1723 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.15 
 
 
3028 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  38.76 
 
 
3884 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.97 
 
 
3602 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  33.97 
 
 
594 aa  193  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  39.08 
 
 
3159 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  36.6 
 
 
2758 aa  190  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  34.9 
 
 
3443 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  37.44 
 
 
6274 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  34.9 
 
 
5212 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40 
 
 
3967 aa  189  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  34.35 
 
 
3563 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  38.08 
 
 
3301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  35.2 
 
 
3141 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  35.2 
 
 
3141 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  34.73 
 
 
3131 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.76 
 
 
3040 aa  184  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  39.05 
 
 
3785 aa  184  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  36.64 
 
 
3144 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  36.19 
 
 
3141 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.51 
 
 
3020 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  38.48 
 
 
3501 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  36.03 
 
 
3526 aa  179  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  37.19 
 
 
4966 aa  178  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  35.9 
 
 
3552 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.36 
 
 
1730 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  36.27 
 
 
3004 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.59 
 
 
3862 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  39.53 
 
 
3790 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  37.5 
 
 
2449 aa  169  8e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.06 
 
 
3796 aa  168  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  32.48 
 
 
2827 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  37.74 
 
 
5981 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.42 
 
 
3128 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.18 
 
 
2670 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  34.32 
 
 
3165 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  36.07 
 
 
1719 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  36.07 
 
 
2350 aa  153  5.9999999999999996e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  32.8 
 
 
812 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  40.35 
 
 
1270 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.33 
 
 
721 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.11 
 
 
923 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  32.11 
 
 
3081 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4482  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.55 
 
 
1615 aa  130  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751989  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  30.7 
 
 
1489 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4077  putative hemagglutinin/hemolysin  30.16 
 
 
463 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4642  hemolysin  31.64 
 
 
1651 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154721  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4272  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.58 
 
 
1508 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0744  hemagglutination activity domain-containing protein  29.73 
 
 
1745 aa  123  6e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0630487  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  34.47 
 
 
1618 aa  123  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1449  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.84 
 
 
1508 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.97 
 
 
1508 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21388  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3922  hemagglutination activity domain-containing protein  32.61 
 
 
1635 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  33.45 
 
 
3929 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4170  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.9 
 
 
1508 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0207391  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4128  hypothetical protein  30.37 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0784897  normal  0.299338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0085  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.37 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.741703  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6763  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.3 
 
 
678 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198523  normal  0.504968 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0155  filamentous haemagglutinin / adhesin  30.03 
 
 
1841 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  30.06 
 
 
2536 aa  99.8  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0801  hemagglutinin, homlog  31.23 
 
 
893 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2480  hemagglutinin-like protein  31.23 
 
 
914 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1756  hemagglutinin, homlog  31.23 
 
 
905 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.982994  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1614  hemagglutinin, homlog  31.23 
 
 
905 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2341  hemagglutinin-like protein  31.23 
 
 
901 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1822  hemagglutinin, homlog  31.23 
 
 
898 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0492  hemagglutinin-like protein  31.23 
 
 
911 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.28 
 
 
2666 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0284  adhesin HecA family  25.7 
 
 
2651 aa  94.4  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0152  filamentous haemagglutinin  28.43 
 
 
716 aa  94  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5056  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.83 
 
 
847 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776969  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.22 
 
 
2847 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.27 
 
 
2818 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7335  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.83 
 
 
681 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.989933  normal  0.505585 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3183  hemagglutinin-like signal peptide protein  28.22 
 
 
846 aa  87.4  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855089  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5359  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.71 
 
 
678 aa  87.8  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.627453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1420  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.11 
 
 
671 aa  86.7  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.850328  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04813  hemagglutinin-like signal peptide protein  28.9 
 
 
846 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.565889  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4028  adhesin HecA family  25.06 
 
 
2964 aa  86.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5443  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.97 
 
 
730 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.34159  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2044  adhesin/hemagglutinin  38.58 
 
 
1615 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.105561  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0006  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.31 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>