38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3785 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3785  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  769    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3423  hypothetical protein  83.03 
 
 		 392 aa  649    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3272  hypothetical protein  83.29 
 
 		 392 aa  647    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.388567  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2502  hypothetical protein  77.58 
 
 		 394 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.156303  hitchhiker  0.000706101 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1839  hypothetical protein  77.32 
 
 		 391 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157174  normal  0.968592 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2718  hypothetical protein  78.48 
 
 		 384 aa  588  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1658  hypothetical protein  77.43 
 
 		 384 aa  585  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0600351  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2681  hypothetical protein  27.47 
 
 		 405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.433082  hitchhiker  0.00146512 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2271  hypothetical protein  25.07 
 
 		 393 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4593  hypothetical protein  23.68 
 
 		 394 aa  133  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3954  hypothetical protein  22.28 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0238  hypothetical protein  22.28 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3740  hypothetical protein  22.96 
 
 		 393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3670  hypothetical protein  23.97 
 
 		 393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0348  hypothetical protein  22.96 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3841  hypothetical protein  23.71 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3743  hypothetical protein  23.97 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0396479 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3670  hypothetical protein  23.97 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.279689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3833  hypothetical protein  23.21 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3560  hypothetical protein  22.96 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0348  major facilitator superfamily MFS_1  23.21 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03167  hypothetical protein  22.96 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03215  hypothetical protein  22.96 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3778  hypothetical protein  23.71 
 
 		 393 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.974681 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3646  hypothetical protein  23.21 
 
 		 393 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865659  hitchhiker  0.000149858 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4675  hypothetical protein  23.21 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.398829 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3713  hypothetical protein  22.1 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3791  hypothetical protein  23.72 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0509  hypothetical protein  21.95 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0551  hypothetical protein  23.62 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  18.91 
 
 		 422 aa  57  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 433 aa  49.7  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  21.89 
 
 		 449 aa  46.6  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 395 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 402 aa  42.7  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>