128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0530 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  431  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  58.88 
 
 		 209 aa  252  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  58.45 
 
 		 213 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  50 
 
 		 208 aa  209  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  47.09 
 
 		 206 aa  194  9e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  49 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  46.8 
 
 		 212 aa  191  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  43.35 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  47.67 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  41.83 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  42.86 
 
 		 207 aa  167  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  40.31 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  29.38 
 
 		 223 aa  99.4  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  29.19 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  28.33 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  26.83 
 
 		 259 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  31.84 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  29.23 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  29.23 
 
 		 238 aa  89.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  32.51 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  31.09 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  31.66 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  26.29 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  29.29 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  25.37 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  29.74 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  29.74 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  28.8 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  26.26 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  27.96 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  26.9 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  29.03 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  25.11 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  30.85 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  22.75 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  25.13 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  26.6 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  28.95 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  27.32 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  25.71 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  26.02 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  26.13 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  28.11 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  25.82 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  27.22 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  24.77 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  24.04 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  24.46 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  24.46 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  24.46 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  27.01 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  26.09 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  25.54 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  27.92 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  29.26 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  24.87 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  26.09 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  25.14 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  26.88 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  25.51 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  25.54 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  25.65 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  24.49 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 		 305 aa  52  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 236 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  29.85 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  28.24 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  21.76 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  30.36 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  18.96 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  24.12 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  22.28 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  26.06 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  22.95 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  26.78 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  30.36 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  30.36 
 
 		 243 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  24.74 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10938  DSBA-like thioredoxin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G06250)  25 
 
 		 262 aa  46.6  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487418  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  21.67 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  27.78 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  23.81 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  23.62 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  29.46 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  23.32 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  24.18 
 
 		 229 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  28.19 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  27.22 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  28.09 
 
 		 242 aa  45.1  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  22.95 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  21.76 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>