35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6283 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6283  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  834    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1163  hypothetical protein  58.7 
 
 
400 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.340868  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2855  hypothetical protein  53.75 
 
 
403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5323  hypothetical protein  49.49 
 
 
397 aa  381  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36800  hypothetical protein  52.66 
 
 
482 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0161837  normal  0.220338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4722  hypothetical protein  51.1 
 
 
389 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347098  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5107  hypothetical protein  51.1 
 
 
389 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129857  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4808  hypothetical protein  51.1 
 
 
389 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4108  putative secreted protein  49.59 
 
 
455 aa  349  4e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0087  pyrrolo-quinoline quinone  49.72 
 
 
454 aa  349  5e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0152  pyrrolo-quinoline quinone  49.06 
 
 
429 aa  342  8e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0563094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2871  hypothetical protein  42.25 
 
 
410 aa  325  7e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3748  putative secreted protein  46.37 
 
 
434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440402  hitchhiker  0.00438258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3560  putative secreted protein  44.35 
 
 
408 aa  300  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2434  hypothetical protein  43.82 
 
 
414 aa  297  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0090  Pyrrolo-quinoline quinone  47.84 
 
 
444 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30770  hypothetical protein  41.5 
 
 
444 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1380  hypothetical protein  39.62 
 
 
447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369053  normal  0.0607438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1070  hypothetical protein  43.13 
 
 
404 aa  262  6.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21130  hypothetical protein  39.18 
 
 
493 aa  240  4e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4097  hypothetical protein  27.74 
 
 
412 aa  93.2  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4007  hypothetical protein  27.27 
 
 
402 aa  89.7  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275688  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2473  hypothetical protein  24.63 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2837  hypothetical protein  24.72 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2378  hypothetical protein  26.97 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.898929  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1598  hypothetical protein  26.52 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0294  putative lipoprotein  27.08 
 
 
465 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0347372  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1977  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.3 
 
 
451 aa  57  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200738  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2445  hypothetical protein  21.9 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3290  hypothetical protein  23.46 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2857  lipoprotein  28.32 
 
 
405 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4724  putative ABC transporter  24.29 
 
 
254 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44347  predicted protein  25.39 
 
 
646 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00207317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4810  putative ABC transporter  24.29 
 
 
257 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.582677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5109  hypothetical protein  24.29 
 
 
407 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.193911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>