More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5990 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5990  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 467 aa  915    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.122747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0318  cysteine desulfurase  61.68 
 
 		 414 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159519  hitchhiker  0.000213792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5748  aminotransferase class V  57.41 
 
 		 452 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380552  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0783  Cysteine desulfurase  51.77 
 
 		 484 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0847  aminotransferase class V  56.94 
 
 		 449 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0275  aminotransferase, class V  59.74 
 
 		 414 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9167  Cysteine desulfurase  54.59 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2389  Cysteine desulfurase  47.79 
 
 		 472 aa  372  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000376862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0546  Cysteine desulfurase  50.86 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2656  cysteine desulfurase  48.21 
 
 		 470 aa  363  4e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4922  cysteine desulfurase  49.06 
 
 		 518 aa  362  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2942  Cysteine desulfurase  50.57 
 
 		 480 aa  362  1e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2391  Cysteine desulfurase  51.4 
 
 		 478 aa  360  3e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.855835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3439  cysteine desulfurase  53.1 
 
 		 457 aa  359  5e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0935  aminotransferase class V  51.53 
 
 		 448 aa  356  5e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239367  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0273  aminotransferase class V  51.38 
 
 		 439 aa  350  5e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35010  selenocysteine lyase  50.35 
 
 		 482 aa  346  4e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3438  cysteine desulfurase  48.76 
 
 		 445 aa  342  5.999999999999999e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3118  Cysteine desulfurase  51.28 
 
 		 476 aa  342  8e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0508  Cysteine desulfurase  49.06 
 
 		 487 aa  340  5e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  35.29 
 
 		 452 aa  236  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  34.28 
 
 		 442 aa  236  8e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  31.44 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  32.08 
 
 		 428 aa  230  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  35.1 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.45 
 
 		 414 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.36 
 
 		 412 aa  206  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.21 
 
 		 414 aa  203  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.93 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  35.02 
 
 		 879 aa  200  5e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0201  aminotransferase, class V  31.01 
 
 		 485 aa  199  7e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.22 
 
 		 406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  40.1 
 
 		 425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.22 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.32 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.58 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.74 
 
 		 433 aa  196  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.89 
 
 		 417 aa  195  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.49 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.83 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.69 
 
 		 435 aa  193  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.24 
 
 		 412 aa  193  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  32.36 
 
 		 408 aa  193  5e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  34 
 
 		 418 aa  192  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  37.47 
 
 		 424 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.62 
 
 		 442 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.75 
 
 		 418 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.5 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  37.89 
 
 		 429 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  33.5 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.5 
 
 		 406 aa  192  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.4 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  33.5 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  34.3 
 
 		 395 aa  192  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  35.34 
 
 		 421 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.5 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.58 
 
 		 412 aa  192  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  35.87 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.5 
 
 		 406 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.08 
 
 		 404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2844  cysteine desulfurase  32 
 
 		 460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.52 
 
 		 415 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.32 
 
 		 408 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.25 
 
 		 406 aa  190  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.17 
 
 		 414 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.15 
 
 		 413 aa  190  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33 
 
 		 406 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33 
 
 		 406 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.81 
 
 		 419 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.84 
 
 		 417 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.84 
 
 		 417 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.32 
 
 		 406 aa  189  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.25 
 
 		 406 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33 
 
 		 406 aa  189  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.84 
 
 		 417 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.14 
 
 		 426 aa  189  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  33.09 
 
 		 414 aa  189  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.67 
 
 		 426 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.35 
 
 		 406 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.09 
 
 		 415 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  32.85 
 
 		 414 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.71 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.75 
 
 		 406 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.25 
 
 		 406 aa  188  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.68 
 
 		 429 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33 
 
 		 406 aa  188  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1637  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.59 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.32 
 
 		 409 aa  187  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.68 
 
 		 429 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  35.77 
 
 		 404 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.6 
 
 		 406 aa  187  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.88 
 
 		 429 aa  186  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.75 
 
 		 414 aa  186  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  38.52 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.07 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.75 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.82 
 
 		 407 aa  185  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.35 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  32.61 
 
 		 410 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  29.93 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>