27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2843 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2843  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 401 aa  791    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  27.13 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1244  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.3 
 
 		 515 aa  57  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.37 
 
 		 418 aa  57  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1947  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 507 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.505699  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 770 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 804 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  31.52 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  26.21 
 
 		 418 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7529  transcriptional regulator, XRE family  26.32 
 
 		 457 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 802 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0250  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 335 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3404  XRE family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0980  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 117 aa  45.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  39.66 
 
 		 262 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2311  helix-turn-helix domain-containing protein  36.99 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.4937 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 151 aa  44.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4118  formylmethionine deformylase  36.23 
 
 		 506 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3185  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 421 aa  43.9  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  25.46 
 
 		 503 aa  43.9  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0225  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 792 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 461 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1962  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 410 aa  43.1  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.622079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3156  helix-turn-helix domain protein  35.06 
 
 		 272 aa  43.1  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.263344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 277 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4540  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 506 aa  43.1  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129106  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>