201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1661 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1661  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 162 aa  313  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  54.36 
 
 		 151 aa  158  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  54.36 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  51.32 
 
 		 154 aa  140  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  52.41 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  52.41 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  52.41 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  51.66 
 
 		 153 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  51.32 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 153 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  51.08 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  49.64 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 153 aa  130  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  49.35 
 
 		 163 aa  130  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2518  Endoribonuclease L-PSP  54.79 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0151498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  49.33 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  54.3 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  51.47 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  48.08 
 
 		 177 aa  127  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  51.72 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  49.01 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  49.66 
 
 		 155 aa  124  8.000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  50.34 
 
 		 151 aa  123  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  45.64 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  48 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  46.26 
 
 		 151 aa  120  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  47.59 
 
 		 155 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  47.68 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  48.98 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  51.66 
 
 		 162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  52.29 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  43.62 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0426  Endoribonuclease L-PSP  48.61 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1999  endoribonuclease L-PSP  49.66 
 
 		 161 aa  111  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 155 aa  111  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  44.9 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  37.42 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  39.46 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  38.67 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04880  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  45.21 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  47.44 
 
 		 189 aa  107  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  41.06 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  37.42 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  36.42 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  39.26 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  37.25 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  42.48 
 
 		 407 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  40.82 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  36.6 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  36.6 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 162 aa  101  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  42.07 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  40.56 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  42.58 
 
 		 157 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  35.26 
 
 		 170 aa  98.2  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  40.94 
 
 		 409 aa  97.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  40.13 
 
 		 155 aa  97.4  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  33.99 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  33.77 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  33.77 
 
 		 156 aa  95.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  33.77 
 
 		 156 aa  95.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  35.57 
 
 		 155 aa  94.4  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  37.09 
 
 		 163 aa  94.4  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 155 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  38.51 
 
 		 155 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  39.73 
 
 		 152 aa  94  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  40.28 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  38.51 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  38.96 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7001  Endoribonuclease L-PSP  34.87 
 
 		 153 aa  91.3  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  42 
 
 		 157 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  37.58 
 
 		 160 aa  90.5  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  37.09 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2988  endoribonuclease L-PSP  39.87 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  37.97 
 
 		 162 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2908  Endoribonuclease L-PSP  37.35 
 
 		 164 aa  87.8  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0814  hypothetical protein  39.07 
 
 		 170 aa  88.2  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.565462  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0607  Endoribonuclease L-PSP  46.75 
 
 		 155 aa  87.4  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  33.33 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6842  Endoribonuclease L-PSP  36.18 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173433 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  34.69 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>