More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1333 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1333  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 140 aa  280  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0880682 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  53.68 
 
 		 143 aa  131  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  51.47 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  51.82 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  48.2 
 
 		 141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  48.2 
 
 		 141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  51.56 
 
 		 142 aa  127  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  51.91 
 
 		 143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  48.92 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  48.2 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  48.09 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  48.06 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  50.77 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  50 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  48.2 
 
 		 142 aa  124  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  45 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  46.76 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  45.32 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  48.2 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  51.16 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  49.24 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  50 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5964  50S ribosomal protein L11  48.53 
 
 		 143 aa  120  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.666277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  46.76 
 
 		 140 aa  121  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  49.26 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  48.2 
 
 		 141 aa  120  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  47.48 
 
 		 141 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  47.48 
 
 		 141 aa  120  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  50.39 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  48.84 
 
 		 142 aa  120  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  46.04 
 
 		 141 aa  120  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  45.32 
 
 		 140 aa  120  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  46.76 
 
 		 140 aa  120  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  46.76 
 
 		 140 aa  120  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  45.32 
 
 		 141 aa  119  9e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  45.32 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  48.84 
 
 		 163 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  47.33 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5110  ribosomal protein L11  47.29 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0690827  normal  0.715797 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  43.17 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  43.88 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  48.84 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  44.6 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  47.06 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  47.06 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  44.6 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  48.06 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1069  50S ribosomal protein L11  47.69 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  0.908798 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3937  50S ribosomal protein L11  48.09 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4329  50S ribosomal protein L11  48.09 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  48.84 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  46.32 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1014  ribosomal protein L11  48.84 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  46.32 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  47.33 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  44.6 
 
 		 141 aa  116  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  43.88 
 
 		 141 aa  116  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29870  LSU ribosomal protein L11P  48.09 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.987247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  46.32 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  48.09 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1174  ribosomal protein L11  46.1 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000246208  unclonable  0.0000000192361 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  46.43 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  45.65 
 
 		 145 aa  115  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21020  LSU ribosomal protein L11P  47.33 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  48.44 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  46.56 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  46.43 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  45.32 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  46.32 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  45.32 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  45.32 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  47.33 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  46.04 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  44.85 
 
 		 162 aa  114  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  42.45 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0302  50S ribosomal protein L11  46.43 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000139433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  45.32 
 
 		 140 aa  114  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  43.88 
 
 		 140 aa  114  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  46.32 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  45.74 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  43.88 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  44.6 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1823  50S ribosomal protein L11  40.71 
 
 		 142 aa  114  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  42.45 
 
 		 141 aa  113  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  44.96 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  44.6 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4116  50S ribosomal protein L11P  46.88 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  45.32 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  43.88 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3472  50S ribosomal protein L11  41.84 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  44.06 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1346  50S ribosomal protein L11  42.55 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0308  50S ribosomal protein L11  47.41 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000373457  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0315  50S ribosomal protein L11  45.69 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000425279  hitchhiker  0.000807121 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  44.19 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0356  50S ribosomal protein L11  48.28 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000696128 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  44.29 
 
 		 164 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  44.53 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  44.53 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  44.53 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>